Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNFSF9P41273 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNFSF9P41273 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNFSF9P41273 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNFSF9P41273 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNFSF9P41273 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNFSF9P41273 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNFSF9P41273 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNFSF9P41273 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNFSF9P41273 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNFSF9P41273 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNFSF9P41273 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNFSF9P41273 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNFSF9P41273 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNFSF9P41273 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNFSF9P41273 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNFSF9P41273 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNFSF9P41273 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNFSF9P41273 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNFSF9P41273 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNFSF9P41273 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNFSF9P41273 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNFSF9P41273 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNFSF9P41273 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNFSF9P41273 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNFSF9P41273 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFSF9P41273 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFSF9P41273 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNFSF9P41273 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFSF9P41273 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFSF9P41273 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFSF9P41273 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFSF9P41273 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFSF9P41273 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFSF9P41273 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFSF9P41273 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFSF9P41273 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFSF9P41273 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFSF9P41273 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFSF9P41273 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFSF9P41273 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFSF9P41273 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFSF9P41273 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFSF9P41273 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFSF9P41273 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNFSF9P41273 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNFSF9P41273 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNFSF9P41273 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNFSF9P41273 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFSF9P41273 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFSF9P41273 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFSF9P41273 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms