Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ETFBP38117 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ETFBP38117 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ETFBP38117 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ETFBP38117 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ETFBP38117 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ETFBP38117 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ETFBP38117 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ETFBP38117 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ETFBP38117 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ETFBP38117 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ETFBP38117 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ETFBP38117 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ETFBP38117 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ETFBP38117 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ETFBP38117 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ETFBP38117 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ETFBP38117 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ETFBP38117 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ETFBP38117 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ETFBP38117 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ETFBP38117 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ETFBP38117 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ETFBP38117 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ETFBP38117 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ETFBP38117 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ETFBP38117 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ETFBP38117 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ETFBP38117 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ETFBP38117 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ETFBP38117 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ETFBP38117 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ETFBP38117 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ETFBP38117 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ETFBP38117 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ETFBP38117 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ETFBP38117 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ETFBP38117 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ETFBP38117 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ETFBP38117 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ETFBP38117 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ETFBP38117 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ETFBP38117 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ETFBP38117 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ETFBP38117 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ETFBP38117 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ETFBP38117 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ETFBP38117 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ETFBP38117 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ETFBP38117 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ETFBP38117 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ETFBP38117 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ETFBP38117 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ETFBP38117 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ETFBP38117 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ETFBP38117 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ETFBP38117 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ETFBP38117 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ETFBP38117 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ETFBP38117 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ETFBP38117 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ETFBP38117 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ETFBP38117 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ETFBP38117 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ETFBP38117 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ETFBP38117 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ETFBP38117 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ETFBP38117 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ETFBP38117 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ETFBP38117 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ETFBP38117 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ETFBP38117 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ETFBP38117 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ETFBP38117 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ETFBP38117 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ETFBP38117 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ETFBP38117 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ETFBP38117 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ETFBP38117 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ETFBP38117 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ETFBP38117 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ETFBP38117 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ETFBP38117 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ETFBP38117 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ETFBP38117 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ETFBP38117 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ETFBP38117 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ETFBP38117 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ETFBP38117 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ETFBP38117 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ETFBP38117 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ETFBP38117 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ETFBP38117 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ETFBP38117 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ETFBP38117 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ETFBP38117 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ETFBP38117 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ETFBP38117 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ETFBP38117 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ETFBP38117 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms