Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINF1P36955 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINF1P36955 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINF1P36955 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINF1P36955 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINF1P36955 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINF1P36955 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINF1P36955 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINF1P36955 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINF1P36955 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINF1P36955 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINF1P36955 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINF1P36955 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINF1P36955 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINF1P36955 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINF1P36955 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINF1P36955 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERPINF1P36955 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINF1P36955 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINF1P36955 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINF1P36955 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms