Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL4P36578 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL4P36578 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL4P36578 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL4P36578 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL4P36578 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL4P36578 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL4P36578 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL4P36578 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL4P36578 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL4P36578 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL4P36578 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL4P36578 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL4P36578 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL4P36578 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL4P36578 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL4P36578 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL4P36578 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL4P36578 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL4P36578 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL4P36578 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL4P36578 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL4P36578 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL4P36578 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL4P36578 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL4P36578 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL4P36578 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL4P36578 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL4P36578 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL4P36578 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL4P36578 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL4P36578 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL4P36578 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL4P36578 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL4P36578 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL4P36578 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL4P36578 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL4P36578 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPL4P36578 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL4P36578 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL4P36578 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL4P36578 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL4P36578 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL4P36578 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL4P36578 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL4P36578 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL4P36578 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL4P36578 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL4P36578 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL4P36578 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL4P36578 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL4P36578 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL4P36578 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL4P36578 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL4P36578 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL4P36578 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL4P36578 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL4P36578 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL4P36578 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL4P36578 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL4P36578 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL4P36578 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL4P36578 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL4P36578 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL4P36578 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL4P36578 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL4P36578 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL4P36578 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL4P36578 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL4P36578 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL4P36578 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL4P36578 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL4P36578 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL4P36578 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL4P36578 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL4P36578 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL4P36578 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL4P36578 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL4P36578 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL4P36578 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL4P36578 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL4P36578 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL4P36578 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL4P36578 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL4P36578 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL4P36578 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL4P36578 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL4P36578 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL4P36578 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL4P36578 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL4P36578 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL4P36578 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL4P36578 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL4P36578 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL4P36578 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL4P36578 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL4P36578 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL4P36578 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL4P36578 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL4P36578 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms