Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJC1P36383 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJC1P36383 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJC1P36383 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJC1P36383 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJC1P36383 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJC1P36383 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJC1P36383 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJC1P36383 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJC1P36383 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJC1P36383 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJC1P36383 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJC1P36383 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJC1P36383 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJC1P36383 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJC1P36383 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJC1P36383 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJC1P36383 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJC1P36383 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJC1P36383 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJC1P36383 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJC1P36383 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJC1P36383 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJC1P36383 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJC1P36383 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJC1P36383 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GJC1P36383 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJC1P36383 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJC1P36383 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJC1P36383 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJC1P36383 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJC1P36383 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJC1P36383 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GJC1P36383 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJC1P36383 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJC1P36383 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJC1P36383 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GJC1P36383 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJC1P36383 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJC1P36383 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJC1P36383 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJC1P36383 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJC1P36383 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJC1P36383 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJC1P36383 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJC1P36383 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJC1P36383 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJC1P36383 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJC1P36383 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJC1P36383 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJC1P36383 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJC1P36383 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJC1P36383 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJC1P36383 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJC1P36383 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJC1P36383 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJC1P36383 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJC1P36383 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJC1P36383 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJC1P36383 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJC1P36383 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJC1P36383 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJC1P36383 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJC1P36383 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GJC1P36383 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJC1P36383 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJC1P36383 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJC1P36383 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJC1P36383 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJC1P36383 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJC1P36383 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJC1P36383 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJC1P36383 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJC1P36383 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJC1P36383 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJC1P36383 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GJC1P36383 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJC1P36383 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJC1P36383 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJC1P36383 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJC1P36383 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJC1P36383 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
GJC1P36383 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GJC1P36383 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJC1P36383 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJC1P36383 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJC1P36383 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJC1P36383 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJC1P36383 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJC1P36383 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJC1P36383 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJC1P36383 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJC1P36383 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJC1P36383 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJC1P36383 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJC1P36383 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJC1P36383 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJC1P36383 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJC1P36383 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJC1P36383 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms