Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GJC1P36383 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GJC1P36383 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
GJC1P36383 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GJC1P36383 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
GJC1P36383 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GJC1P36383 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GJC1P36383 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJC1P36383 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GJC1P36383 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GJC1P36383 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
GJC1P36383 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GJC1P36383 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GJC1P36383 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GJC1P36383 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GJC1P36383 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GJC1P36383 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GJC1P36383 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GJC1P36383 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GJC1P36383 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
GJC1P36383 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GJC1P36383 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GJC1P36383 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJC1P36383 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GJC1P36383 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJC1P36383 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJC1P36383 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GJC1P36383 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GJC1P36383 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GJC1P36383 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GJC1P36383 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJC1P36383 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJC1P36383 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GJC1P36383 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJC1P36383 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GJC1P36383 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GJC1P36383 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJC1P36383 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GJC1P36383 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GJC1P36383 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GJC1P36383 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GJC1P36383 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GJC1P36383 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GJC1P36383 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GJC1P36383 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GJC1P36383 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJC1P36383 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GJC1P36383 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJC1P36383 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJC1P36383 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJC1P36383 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJC1P36383 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJC1P36383 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJC1P36383 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJC1P36383 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJC1P36383 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJC1P36383 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJC1P36383 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJC1P36383 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJC1P36383 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJC1P36383 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJC1P36383 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJC1P36383 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJC1P36383 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJC1P36383 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJC1P36383 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJC1P36383 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJC1P36383 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJC1P36383 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJC1P36383 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJC1P36383 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJC1P36383 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJC1P36383 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJC1P36383 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GJC1P36383 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GJC1P36383 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GJC1P36383 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJC1P36383 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJC1P36383 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GJC1P36383 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GJC1P36383 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GJC1P36383 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJC1P36383 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJC1P36383 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJC1P36383 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJC1P36383 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GJC1P36383 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJC1P36383 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GJC1P36383 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJC1P36383 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJC1P36383 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJC1P36383 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJC1P36383 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJC1P36383 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJC1P36383 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJC1P36383 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJC1P36383 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJC1P36383 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJC1P36383 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJC1P36383 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms