Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXC13P31276 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXC13P31276 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXC13P31276 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXC13P31276 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXC13P31276 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC13P31276 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC13P31276 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC13P31276 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HOXC13P31276 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
HOXC13P31276 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXC13P31276 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXC13P31276 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXC13P31276 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXC13P31276 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC13P31276 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC13P31276 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXC13P31276 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXC13P31276 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXC13P31276 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOXC13P31276 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC13P31276 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC13P31276 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC13P31276 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC13P31276 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXC13P31276 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXC13P31276 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC13P31276 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC13P31276 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC13P31276 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC13P31276 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC13P31276 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC13P31276 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC13P31276 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC13P31276 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC13P31276 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC13P31276 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC13P31276 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC13P31276 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC13P31276 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC13P31276 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC13P31276 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC13P31276 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC13P31276 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms