Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPIFP30405 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPIFP30405 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPIFP30405 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIFP30405 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIFP30405 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIFP30405 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPIFP30405 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PPIFP30405 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPIFP30405 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPIFP30405 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPIFP30405 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPIFP30405 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPIFP30405 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPIFP30405 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPIFP30405 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPIFP30405 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPIFP30405 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPIFP30405 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPIFP30405 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPIFP30405 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIFP30405 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIFP30405 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIFP30405 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIFP30405 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIFP30405 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIFP30405 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIFP30405 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIFP30405 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIFP30405 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPIFP30405 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPIFP30405 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPIFP30405 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPIFP30405 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPIFP30405 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIFP30405 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIFP30405 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPIFP30405 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPIFP30405 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPIFP30405 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIFP30405 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIFP30405 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPIFP30405 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIFP30405 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPIFP30405 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIFP30405 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPIFP30405 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPIFP30405 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPIFP30405 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPIFP30405 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPIFP30405 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPIFP30405 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPIFP30405 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPIFP30405 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPIFP30405 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPIFP30405 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPIFP30405 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPIFP30405 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPIFP30405 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPIFP30405 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPIFP30405 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPIFP30405 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPIFP30405 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPIFP30405 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPIFP30405 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPIFP30405 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPIFP30405 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPIFP30405 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PPIFP30405 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPIFP30405 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPIFP30405 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPIFP30405 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPIFP30405 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPIFP30405 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPIFP30405 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PPIFP30405 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPIFP30405 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPIFP30405 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPIFP30405 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPIFP30405 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPIFP30405 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPIFP30405 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPIFP30405 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPIFP30405 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPIFP30405 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPIFP30405 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPIFP30405 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPIFP30405 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PPIFP30405 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPIFP30405 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPIFP30405 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPIFP30405 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPIFP30405 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPIFP30405 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPIFP30405 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPIFP30405 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPIFP30405 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPIFP30405 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPIFP30405 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPIFP30405 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms