Protein–RNA interactions for Protein: P29401

TKT, Transketolase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TKTP29401 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TKTP29401 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TKTP29401 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TKTP29401 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TKTP29401 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TKTP29401 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TKTP29401 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TKTP29401 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TKTP29401 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TKTP29401 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TKTP29401 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TKTP29401 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TKTP29401 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TKTP29401 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TKTP29401 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TKTP29401 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TKTP29401 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TKTP29401 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TKTP29401 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TKTP29401 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TKTP29401 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TKTP29401 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TKTP29401 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TKTP29401 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TKTP29401 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TKTP29401 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TKTP29401 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TKTP29401 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TKTP29401 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TKTP29401 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TKTP29401 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TKTP29401 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TKTP29401 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TKTP29401 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TKTP29401 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TKTP29401 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TKTP29401 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TKTP29401 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TKTP29401 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TKTP29401 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TKTP29401 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TKTP29401 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TKTP29401 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TKTP29401 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TKTP29401 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TKTP29401 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TKTP29401 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TKTP29401 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TKTP29401 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TKTP29401 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TKTP29401 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TKTP29401 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TKTP29401 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TKTP29401 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TKTP29401 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TKTP29401 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TKTP29401 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TKTP29401 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TKTP29401 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TKTP29401 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TKTP29401 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TKTP29401 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TKTP29401 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TKTP29401 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TKTP29401 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TKTP29401 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TKTP29401 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TKTP29401 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TKTP29401 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TKTP29401 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TKTP29401 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TKTP29401 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TKTP29401 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TKTP29401 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TKTP29401 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TKTP29401 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TKTP29401 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TKTP29401 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TKTP29401 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TKTP29401 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TKTP29401 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TKTP29401 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TKTP29401 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TKTP29401 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TKTP29401 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TKTP29401 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TKTP29401 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TKTP29401 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TKTP29401 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TKTP29401 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TKTP29401 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TKTP29401 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TKTP29401 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TKTP29401 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TKTP29401 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TKTP29401 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TKTP29401 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TKTP29401 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TKTP29401 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TKTP29401 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms