Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHC1P29353 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHC1P29353 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHC1P29353 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHC1P29353 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHC1P29353 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHC1P29353 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHC1P29353 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHC1P29353 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC1P29353 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC1P29353 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC1P29353 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC1P29353 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC1P29353 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC1P29353 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC1P29353 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC1P29353 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC1P29353 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC1P29353 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC1P29353 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC1P29353 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC1P29353 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC1P29353 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC1P29353 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC1P29353 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC1P29353 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC1P29353 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC1P29353 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC1P29353 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC1P29353 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC1P29353 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC1P29353 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHC1P29353 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHC1P29353 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHC1P29353 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC1P29353 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC1P29353 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC1P29353 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC1P29353 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC1P29353 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC1P29353 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC1P29353 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC1P29353 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC1P29353 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHC1P29353 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHC1P29353 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHC1P29353 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHC1P29353 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHC1P29353 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC1P29353 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC1P29353 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC1P29353 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC1P29353 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHC1P29353 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHC1P29353 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHC1P29353 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHC1P29353 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHC1P29353 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SHC1P29353 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SHC1P29353 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHC1P29353 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHC1P29353 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC1P29353 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC1P29353 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC1P29353 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC1P29353 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC1P29353 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC1P29353 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC1P29353 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC1P29353 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC1P29353 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC1P29353 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC1P29353 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC1P29353 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC1P29353 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC1P29353 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC1P29353 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC1P29353 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC1P29353 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC1P29353 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC1P29353 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHC1P29353 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC1P29353 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC1P29353 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC1P29353 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC1P29353 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHC1P29353 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHC1P29353 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHC1P29353 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHC1P29353 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC1P29353 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC1P29353 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC1P29353 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC1P29353 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC1P29353 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHC1P29353 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHC1P29353 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHC1P29353 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHC1P29353 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC1P29353 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms