Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR1P24046 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR1P24046 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRR1P24046 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRR1P24046 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRR1P24046 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRR1P24046 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRR1P24046 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRR1P24046 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRR1P24046 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRR1P24046 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRR1P24046 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRR1P24046 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRR1P24046 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRR1P24046 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRR1P24046 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRR1P24046 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRR1P24046 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRR1P24046 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRR1P24046 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRR1P24046 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRR1P24046 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRR1P24046 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRR1P24046 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRR1P24046 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRR1P24046 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms