Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTGS1P23219 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTGS1P23219 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTGS1P23219 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTGS1P23219 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTGS1P23219 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTGS1P23219 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTGS1P23219 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTGS1P23219 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTGS1P23219 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTGS1P23219 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTGS1P23219 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTGS1P23219 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTGS1P23219 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTGS1P23219 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTGS1P23219 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTGS1P23219 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTGS1P23219 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTGS1P23219 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTGS1P23219 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTGS1P23219 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTGS1P23219 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTGS1P23219 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTGS1P23219 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTGS1P23219 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTGS1P23219 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTGS1P23219 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTGS1P23219 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTGS1P23219 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTGS1P23219 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTGS1P23219 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTGS1P23219 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PTGS1P23219 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTGS1P23219 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTGS1P23219 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PTGS1P23219 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTGS1P23219 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTGS1P23219 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTGS1P23219 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTGS1P23219 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTGS1P23219 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTGS1P23219 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTGS1P23219 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTGS1P23219 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTGS1P23219 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTGS1P23219 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTGS1P23219 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTGS1P23219 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTGS1P23219 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTGS1P23219 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTGS1P23219 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTGS1P23219 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTGS1P23219 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTGS1P23219 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTGS1P23219 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTGS1P23219 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTGS1P23219 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTGS1P23219 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PTGS1P23219 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PTGS1P23219 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTGS1P23219 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTGS1P23219 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTGS1P23219 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTGS1P23219 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms