Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PTGS1P23219 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTGS1P23219 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTGS1P23219 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTGS1P23219 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTGS1P23219 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTGS1P23219 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTGS1P23219 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTGS1P23219 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
PTGS1P23219 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PTGS1P23219 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTGS1P23219 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTGS1P23219 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTGS1P23219 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTGS1P23219 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTGS1P23219 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTGS1P23219 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTGS1P23219 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTGS1P23219 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTGS1P23219 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTGS1P23219 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTGS1P23219 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTGS1P23219 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTGS1P23219 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTGS1P23219 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTGS1P23219 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTGS1P23219 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTGS1P23219 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTGS1P23219 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTGS1P23219 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTGS1P23219 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTGS1P23219 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTGS1P23219 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTGS1P23219 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTGS1P23219 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTGS1P23219 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PTGS1P23219 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTGS1P23219 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTGS1P23219 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTGS1P23219 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTGS1P23219 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTGS1P23219 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTGS1P23219 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTGS1P23219 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTGS1P23219 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTGS1P23219 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTGS1P23219 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTGS1P23219 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTGS1P23219 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PTGS1P23219 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTGS1P23219 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
PTGS1P23219 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PTGS1P23219 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTGS1P23219 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTGS1P23219 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTGS1P23219 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTGS1P23219 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTGS1P23219 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTGS1P23219 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTGS1P23219 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTGS1P23219 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTGS1P23219 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTGS1P23219 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTGS1P23219 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTGS1P23219 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTGS1P23219 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTGS1P23219 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTGS1P23219 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTGS1P23219 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTGS1P23219 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTGS1P23219 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PTGS1P23219 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTGS1P23219 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTGS1P23219 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTGS1P23219 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTGS1P23219 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTGS1P23219 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTGS1P23219 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTGS1P23219 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTGS1P23219 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTGS1P23219 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTGS1P23219 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTGS1P23219 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTGS1P23219 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTGS1P23219 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTGS1P23219 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTGS1P23219 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTGS1P23219 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTGS1P23219 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTGS1P23219 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTGS1P23219 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTGS1P23219 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTGS1P23219 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTGS1P23219 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTGS1P23219 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTGS1P23219 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTGS1P23219 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTGS1P23219 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTGS1P23219 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTGS1P23219 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms