Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USF1P22415 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USF1P22415 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USF1P22415 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USF1P22415 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USF1P22415 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USF1P22415 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USF1P22415 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USF1P22415 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USF1P22415 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USF1P22415 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USF1P22415 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USF1P22415 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USF1P22415 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USF1P22415 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USF1P22415 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USF1P22415 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USF1P22415 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USF1P22415 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USF1P22415 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USF1P22415 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USF1P22415 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USF1P22415 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USF1P22415 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USF1P22415 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USF1P22415 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USF1P22415 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USF1P22415 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USF1P22415 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USF1P22415 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USF1P22415 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USF1P22415 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USF1P22415 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USF1P22415 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USF1P22415 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USF1P22415 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USF1P22415 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USF1P22415 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USF1P22415 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USF1P22415 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USF1P22415 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USF1P22415 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USF1P22415 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USF1P22415 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USF1P22415 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USF1P22415 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USF1P22415 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USF1P22415 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USF1P22415 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USF1P22415 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USF1P22415 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USF1P22415 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USF1P22415 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USF1P22415 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USF1P22415 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USF1P22415 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USF1P22415 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USF1P22415 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USF1P22415 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USF1P22415 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USF1P22415 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USF1P22415 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USF1P22415 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USF1P22415 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USF1P22415 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USF1P22415 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USF1P22415 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USF1P22415 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USF1P22415 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USF1P22415 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USF1P22415 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USF1P22415 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USF1P22415 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USF1P22415 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USF1P22415 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USF1P22415 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USF1P22415 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USF1P22415 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USF1P22415 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USF1P22415 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USF1P22415 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USF1P22415 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USF1P22415 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USF1P22415 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USF1P22415 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USF1P22415 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USF1P22415 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USF1P22415 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USF1P22415 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USF1P22415 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USF1P22415 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USF1P22415 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USF1P22415 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USF1P22415 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USF1P22415 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USF1P22415 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USF1P22415 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USF1P22415 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USF1P22415 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USF1P22415 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms