Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTNP21246 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTNP21246 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTNP21246 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTNP21246 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTNP21246 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTNP21246 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTNP21246 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTNP21246 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTNP21246 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTNP21246 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTNP21246 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTNP21246 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTNP21246 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTNP21246 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTNP21246 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTNP21246 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTNP21246 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTNP21246 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTNP21246 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTNP21246 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTNP21246 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTNP21246 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTNP21246 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTNP21246 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTNP21246 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTNP21246 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTNP21246 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTNP21246 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTNP21246 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTNP21246 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTNP21246 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTNP21246 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTNP21246 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTNP21246 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTNP21246 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTNP21246 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTNP21246 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTNP21246 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTNP21246 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTNP21246 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTNP21246 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTNP21246 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTNP21246 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTNP21246 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTNP21246 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTNP21246 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTNP21246 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTNP21246 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTNP21246 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTNP21246 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTNP21246 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTNP21246 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTNP21246 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTNP21246 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTNP21246 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTNP21246 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTNP21246 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTNP21246 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTNP21246 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTNP21246 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTNP21246 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTNP21246 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTNP21246 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTNP21246 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTNP21246 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTNP21246 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTNP21246 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTNP21246 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTNP21246 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTNP21246 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTNP21246 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTNP21246 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTNP21246 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTNP21246 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTNP21246 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTNP21246 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTNP21246 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTNP21246 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTNP21246 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTNP21246 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTNP21246 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTNP21246 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTNP21246 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTNP21246 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTNP21246 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTNP21246 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTNP21246 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTNP21246 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTNP21246 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTNP21246 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTNP21246 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTNP21246 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTNP21246 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTNP21246 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTNP21246 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTNP21246 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTNP21246 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTNP21246 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTNP21246 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms