Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFNA1P20827 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFNA1P20827 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFNA1P20827 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFNA1P20827 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFNA1P20827 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EFNA1P20827 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EFNA1P20827 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EFNA1P20827 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFNA1P20827 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFNA1P20827 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFNA1P20827 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFNA1P20827 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFNA1P20827 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFNA1P20827 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFNA1P20827 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFNA1P20827 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFNA1P20827 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFNA1P20827 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFNA1P20827 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFNA1P20827 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFNA1P20827 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFNA1P20827 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFNA1P20827 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFNA1P20827 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFNA1P20827 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFNA1P20827 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFNA1P20827 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFNA1P20827 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFNA1P20827 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFNA1P20827 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFNA1P20827 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFNA1P20827 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFNA1P20827 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EFNA1P20827 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFNA1P20827 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFNA1P20827 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFNA1P20827 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFNA1P20827 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFNA1P20827 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFNA1P20827 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFNA1P20827 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFNA1P20827 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EFNA1P20827 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFNA1P20827 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EFNA1P20827 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms