Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF7P17544 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF7P17544 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF7P17544 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF7P17544 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF7P17544 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF7P17544 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF7P17544 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
ATF7P17544 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATF7P17544 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATF7P17544 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF7P17544 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF7P17544 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF7P17544 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF7P17544 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATF7P17544 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATF7P17544 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ATF7P17544 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATF7P17544 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF7P17544 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF7P17544 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF7P17544 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF7P17544 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF7P17544 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF7P17544 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF7P17544 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF7P17544 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF7P17544 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF7P17544 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF7P17544 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF7P17544 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF7P17544 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF7P17544 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF7P17544 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF7P17544 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF7P17544 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF7P17544 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF7P17544 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF7P17544 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF7P17544 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF7P17544 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF7P17544 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF7P17544 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF7P17544 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF7P17544 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF7P17544 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF7P17544 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF7P17544 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF7P17544 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF7P17544 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF7P17544 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF7P17544 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF7P17544 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF7P17544 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF7P17544 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF7P17544 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF7P17544 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF7P17544 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF7P17544 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATF7P17544 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATF7P17544 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATF7P17544 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF7P17544 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF7P17544 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF7P17544 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF7P17544 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF7P17544 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF7P17544 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF7P17544 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF7P17544 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF7P17544 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF7P17544 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF7P17544 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF7P17544 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF7P17544 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF7P17544 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF7P17544 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATF7P17544 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF7P17544 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF7P17544 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF7P17544 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF7P17544 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF7P17544 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF7P17544 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF7P17544 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATF7P17544 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF7P17544 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF7P17544 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF7P17544 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF7P17544 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF7P17544 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF7P17544 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF7P17544 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF7P17544 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF7P17544 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF7P17544 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF7P17544 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF7P17544 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF7P17544 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7P17544 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms