Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FGFR1P11362 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FGFR1P11362 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FGFR1P11362 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
FGFR1P11362 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FGFR1P11362 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FGFR1P11362 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FGFR1P11362 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FGFR1P11362 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FGFR1P11362 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FGFR1P11362 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FGFR1P11362 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FGFR1P11362 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FGFR1P11362 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FGFR1P11362 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGFR1P11362 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGFR1P11362 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FGFR1P11362 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGFR1P11362 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FGFR1P11362 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGFR1P11362 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGFR1P11362 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGFR1P11362 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FGFR1P11362 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FGFR1P11362 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FGFR1P11362 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FGFR1P11362 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FGFR1P11362 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FGFR1P11362 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FGFR1P11362 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FGFR1P11362 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGFR1P11362 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGFR1P11362 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FGFR1P11362 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGFR1P11362 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGFR1P11362 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FGFR1P11362 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGFR1P11362 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGFR1P11362 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGFR1P11362 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGFR1P11362 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGFR1P11362 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGFR1P11362 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGFR1P11362 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms