Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFICP08651 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFICP08651 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFICP08651 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFICP08651 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFICP08651 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFICP08651 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFICP08651 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFICP08651 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFICP08651 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFICP08651 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFICP08651 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFICP08651 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFICP08651 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFICP08651 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFICP08651 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFICP08651 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFICP08651 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFICP08651 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFICP08651 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFICP08651 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFICP08651 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFICP08651 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFICP08651 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFICP08651 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFICP08651 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFICP08651 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFICP08651 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFICP08651 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFICP08651 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFICP08651 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFICP08651 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFICP08651 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFICP08651 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NFICP08651 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFICP08651 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFICP08651 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFICP08651 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFICP08651 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFICP08651 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFICP08651 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFICP08651 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFICP08651 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NFICP08651 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFICP08651 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFICP08651 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFICP08651 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NFICP08651 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFICP08651 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NFICP08651 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFICP08651 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFICP08651 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFICP08651 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFICP08651 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFICP08651 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFICP08651 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NFICP08651 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFICP08651 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NFICP08651 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFICP08651 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFICP08651 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFICP08651 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFICP08651 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFICP08651 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFICP08651 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFICP08651 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFICP08651 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NFICP08651 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFICP08651 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFICP08651 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFICP08651 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFICP08651 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFICP08651 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NFICP08651 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFICP08651 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFICP08651 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFICP08651 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFICP08651 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFICP08651 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFICP08651 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NFICP08651 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFICP08651 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFICP08651 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NFICP08651 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFICP08651 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFICP08651 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NFICP08651 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFICP08651 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFICP08651 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFICP08651 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFICP08651 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFICP08651 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFICP08651 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFICP08651 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFICP08651 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFICP08651 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFICP08651 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFICP08651 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFICP08651 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFICP08651 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms