Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA5P08648 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA5P08648 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA5P08648 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA5P08648 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA5P08648 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms