Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGA5P08648 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGA5P08648 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGA5P08648 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGA5P08648 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGA5P08648 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGA5P08648 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGA5P08648 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGA5P08648 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA5P08648 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA5P08648 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA5P08648 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA5P08648 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA5P08648 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA5P08648 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA5P08648 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA5P08648 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA5P08648 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA5P08648 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGA5P08648 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA5P08648 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA5P08648 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA5P08648 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA5P08648 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA5P08648 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA5P08648 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA5P08648 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA5P08648 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA5P08648 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA5P08648 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA5P08648 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA5P08648 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA5P08648 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA5P08648 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA5P08648 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA5P08648 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA5P08648 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA5P08648 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA5P08648 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA5P08648 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA5P08648 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA5P08648 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA5P08648 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA5P08648 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA5P08648 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA5P08648 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA5P08648 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGA5P08648 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA5P08648 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA5P08648 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA5P08648 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA5P08648 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA5P08648 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA5P08648 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA5P08648 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA5P08648 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA5P08648 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA5P08648 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA5P08648 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA5P08648 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA5P08648 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA5P08648 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA5P08648 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA5P08648 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA5P08648 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA5P08648 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA5P08648 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA5P08648 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA5P08648 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA5P08648 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA5P08648 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA5P08648 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA5P08648 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA5P08648 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA5P08648 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA5P08648 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA5P08648 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA5P08648 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA5P08648 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA5P08648 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA5P08648 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA5P08648 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA5P08648 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA5P08648 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA5P08648 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA5P08648 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA5P08648 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA5P08648 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA5P08648 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA5P08648 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA5P08648 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA5P08648 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGA5P08648 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA5P08648 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA5P08648 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA5P08648 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA5P08648 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA5P08648 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA5P08648 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA5P08648 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms