Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A2O60779 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC19A2O60779 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC19A2O60779 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC19A2O60779 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC19A2O60779 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC19A2O60779 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC19A2O60779 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC19A2O60779 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC19A2O60779 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC19A2O60779 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC19A2O60779 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC19A2O60779 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC19A2O60779 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC19A2O60779 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC19A2O60779 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC19A2O60779 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms