Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LPXNO60711 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LPXNO60711 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LPXNO60711 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPXNO60711 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPXNO60711 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPXNO60711 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LPXNO60711 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LPXNO60711 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LPXNO60711 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LPXNO60711 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LPXNO60711 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LPXNO60711 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LPXNO60711 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LPXNO60711 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LPXNO60711 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LPXNO60711 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LPXNO60711 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LPXNO60711 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LPXNO60711 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LPXNO60711 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LPXNO60711 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LPXNO60711 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LPXNO60711 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LPXNO60711 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LPXNO60711 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LPXNO60711 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LPXNO60711 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LPXNO60711 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LPXNO60711 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPXNO60711 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPXNO60711 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPXNO60711 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LPXNO60711 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LPXNO60711 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LPXNO60711 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LPXNO60711 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LPXNO60711 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LPXNO60711 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LPXNO60711 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LPXNO60711 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LPXNO60711 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LPXNO60711 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LPXNO60711 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LPXNO60711 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LPXNO60711 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPXNO60711 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LPXNO60711 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LPXNO60711 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LPXNO60711 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LPXNO60711 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LPXNO60711 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LPXNO60711 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LPXNO60711 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LPXNO60711 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LPXNO60711 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LPXNO60711 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LPXNO60711 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LPXNO60711 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LPXNO60711 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LPXNO60711 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LPXNO60711 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LPXNO60711 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LPXNO60711 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LPXNO60711 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LPXNO60711 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LPXNO60711 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LPXNO60711 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LPXNO60711 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LPXNO60711 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LPXNO60711 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LPXNO60711 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LPXNO60711 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LPXNO60711 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LPXNO60711 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LPXNO60711 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LPXNO60711 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LPXNO60711 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LPXNO60711 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LPXNO60711 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LPXNO60711 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LPXNO60711 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LPXNO60711 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LPXNO60711 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LPXNO60711 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LPXNO60711 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LPXNO60711 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LPXNO60711 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LPXNO60711 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LPXNO60711 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LPXNO60711 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LPXNO60711 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LPXNO60711 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LPXNO60711 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms