Protein–RNA interactions for Protein: O43745

CHP2, Calcineurin B homologous protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP2O43745 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHP2O43745 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHP2O43745 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHP2O43745 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP2O43745 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP2O43745 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHP2O43745 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHP2O43745 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHP2O43745 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHP2O43745 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHP2O43745 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP2O43745 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP2O43745 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP2O43745 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP2O43745 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP2O43745 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP2O43745 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHP2O43745 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHP2O43745 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHP2O43745 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHP2O43745 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHP2O43745 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHP2O43745 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP2O43745 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHP2O43745 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHP2O43745 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP2O43745 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP2O43745 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP2O43745 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP2O43745 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHP2O43745 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHP2O43745 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHP2O43745 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP2O43745 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP2O43745 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP2O43745 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP2O43745 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP2O43745 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP2O43745 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP2O43745 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP2O43745 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHP2O43745 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHP2O43745 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHP2O43745 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHP2O43745 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP2O43745 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP2O43745 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP2O43745 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP2O43745 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP2O43745 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP2O43745 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP2O43745 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP2O43745 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP2O43745 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHP2O43745 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHP2O43745 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHP2O43745 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP2O43745 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP2O43745 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP2O43745 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP2O43745 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP2O43745 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHP2O43745 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHP2O43745 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP2O43745 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP2O43745 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP2O43745 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP2O43745 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHP2O43745 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHP2O43745 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHP2O43745 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHP2O43745 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP2O43745 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP2O43745 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP2O43745 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP2O43745 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP2O43745 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP2O43745 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP2O43745 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP2O43745 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP2O43745 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHP2O43745 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP2O43745 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP2O43745 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP2O43745 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP2O43745 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP2O43745 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP2O43745 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP2O43745 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP2O43745 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP2O43745 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHP2O43745 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHP2O43745 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHP2O43745 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP2O43745 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHP2O43745 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHP2O43745 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHP2O43745 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHP2O43745 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP2O43745 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms