Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF13O43567 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF13O43567 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF13O43567 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF13O43567 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF13O43567 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF13O43567 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF13O43567 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF13O43567 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF13O43567 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF13O43567 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF13O43567 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF13O43567 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF13O43567 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF13O43567 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF13O43567 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF13O43567 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF13O43567 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF13O43567 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF13O43567 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF13O43567 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF13O43567 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF13O43567 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF13O43567 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF13O43567 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF13O43567 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF13O43567 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF13O43567 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF13O43567 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF13O43567 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF13O43567 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF13O43567 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF13O43567 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF13O43567 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF13O43567 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF13O43567 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF13O43567 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF13O43567 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF13O43567 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF13O43567 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF13O43567 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF13O43567 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF13O43567 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF13O43567 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF13O43567 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF13O43567 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF13O43567 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF13O43567 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF13O43567 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF13O43567 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF13O43567 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF13O43567 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF13O43567 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF13O43567 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF13O43567 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF13O43567 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF13O43567 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF13O43567 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF13O43567 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF13O43567 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF13O43567 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF13O43567 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF13O43567 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF13O43567 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF13O43567 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF13O43567 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF13O43567 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF13O43567 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF13O43567 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF13O43567 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF13O43567 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF13O43567 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF13O43567 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF13O43567 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF13O43567 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF13O43567 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF13O43567 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF13O43567 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF13O43567 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF13O43567 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF13O43567 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF13O43567 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF13O43567 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF13O43567 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF13O43567 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF13O43567 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF13O43567 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF13O43567 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF13O43567 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF13O43567 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF13O43567 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF13O43567 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF13O43567 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF13O43567 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF13O43567 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF13O43567 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF13O43567 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF13O43567 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF13O43567 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF13O43567 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms