Protein–RNA interactions for Protein: O43493

TGOLN2, Trans-Golgi network integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGOLN2O43493 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TGOLN2O43493 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGOLN2O43493 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGOLN2O43493 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGOLN2O43493 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGOLN2O43493 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGOLN2O43493 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGOLN2O43493 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGOLN2O43493 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGOLN2O43493 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGOLN2O43493 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGOLN2O43493 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGOLN2O43493 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGOLN2O43493 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGOLN2O43493 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGOLN2O43493 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGOLN2O43493 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGOLN2O43493 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGOLN2O43493 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGOLN2O43493 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGOLN2O43493 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGOLN2O43493 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGOLN2O43493 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGOLN2O43493 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGOLN2O43493 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGOLN2O43493 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGOLN2O43493 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGOLN2O43493 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGOLN2O43493 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGOLN2O43493 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGOLN2O43493 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGOLN2O43493 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGOLN2O43493 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TGOLN2O43493 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGOLN2O43493 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGOLN2O43493 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGOLN2O43493 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGOLN2O43493 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGOLN2O43493 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGOLN2O43493 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGOLN2O43493 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGOLN2O43493 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGOLN2O43493 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGOLN2O43493 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGOLN2O43493 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms