Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HTRA2O43464 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTRA2O43464 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HTRA2O43464 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTRA2O43464 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTRA2O43464 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTRA2O43464 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTRA2O43464 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTRA2O43464 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTRA2O43464 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTRA2O43464 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTRA2O43464 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTRA2O43464 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTRA2O43464 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTRA2O43464 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTRA2O43464 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTRA2O43464 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTRA2O43464 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTRA2O43464 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTRA2O43464 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTRA2O43464 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTRA2O43464 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTRA2O43464 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTRA2O43464 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTRA2O43464 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTRA2O43464 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTRA2O43464 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTRA2O43464 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTRA2O43464 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTRA2O43464 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTRA2O43464 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTRA2O43464 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTRA2O43464 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTRA2O43464 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTRA2O43464 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTRA2O43464 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTRA2O43464 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HTRA2O43464 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTRA2O43464 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTRA2O43464 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTRA2O43464 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HTRA2O43464 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTRA2O43464 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTRA2O43464 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTRA2O43464 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTRA2O43464 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTRA2O43464 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTRA2O43464 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTRA2O43464 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms