Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN9O14815 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN9O14815 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN9O14815 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN9O14815 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN9O14815 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN9O14815 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN9O14815 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN9O14815 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN9O14815 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN9O14815 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN9O14815 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN9O14815 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN9O14815 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN9O14815 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN9O14815 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN9O14815 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN9O14815 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN9O14815 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN9O14815 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN9O14815 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN9O14815 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN9O14815 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN9O14815 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN9O14815 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN9O14815 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN9O14815 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN9O14815 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN9O14815 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN9O14815 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN9O14815 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN9O14815 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN9O14815 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms