Protein–RNA interactions for Protein: O14617

AP3D1, AP-3 complex subunit delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3D1O14617 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3D1O14617 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3D1O14617 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3D1O14617 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP3D1O14617 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP3D1O14617 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3D1O14617 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3D1O14617 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3D1O14617 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3D1O14617 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3D1O14617 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3D1O14617 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3D1O14617 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3D1O14617 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3D1O14617 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3D1O14617 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3D1O14617 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3D1O14617 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3D1O14617 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3D1O14617 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP3D1O14617 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3D1O14617 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3D1O14617 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3D1O14617 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3D1O14617 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3D1O14617 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3D1O14617 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3D1O14617 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3D1O14617 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3D1O14617 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3D1O14617 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3D1O14617 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3D1O14617 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3D1O14617 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3D1O14617 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3D1O14617 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3D1O14617 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3D1O14617 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AP3D1O14617 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3D1O14617 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3D1O14617 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3D1O14617 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3D1O14617 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3D1O14617 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3D1O14617 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3D1O14617 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3D1O14617 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3D1O14617 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3D1O14617 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3D1O14617 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms