Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF561-AS1K7EIQ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF561-AS1K7EIQ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF561-AS1K7EIQ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF561-AS1K7EIQ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF561-AS1K7EIQ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF561-AS1K7EIQ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF561-AS1K7EIQ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF561-AS1K7EIQ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF561-AS1K7EIQ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms