Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM227AF5H4B4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM227AF5H4B4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM227AF5H4B4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM227AF5H4B4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227AF5H4B4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227AF5H4B4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227AF5H4B4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM227AF5H4B4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227AF5H4B4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM227AF5H4B4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM227AF5H4B4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM227AF5H4B4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM227AF5H4B4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM227AF5H4B4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM227AF5H4B4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM227AF5H4B4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM227AF5H4B4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM227AF5H4B4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM227AF5H4B4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM227AF5H4B4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM227AF5H4B4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM227AF5H4B4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM227AF5H4B4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM227AF5H4B4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
FAM227AF5H4B4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227AF5H4B4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227AF5H4B4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227AF5H4B4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227AF5H4B4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227AF5H4B4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227AF5H4B4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM227AF5H4B4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM227AF5H4B4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227AF5H4B4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227AF5H4B4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227AF5H4B4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227AF5H4B4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227AF5H4B4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227AF5H4B4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227AF5H4B4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227AF5H4B4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM227AF5H4B4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227AF5H4B4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227AF5H4B4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227AF5H4B4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227AF5H4B4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227AF5H4B4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227AF5H4B4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227AF5H4B4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227AF5H4B4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms