Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBD1B2RD01 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBD1B2RD01 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBD1B2RD01 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBD1B2RD01 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBD1B2RD01 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBD1B2RD01 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBD1B2RD01 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBD1B2RD01 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBD1B2RD01 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBD1B2RD01 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBD1B2RD01 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPBD1B2RD01 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPBD1B2RD01 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBD1B2RD01 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBD1B2RD01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBD1B2RD01 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBD1B2RD01 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBD1B2RD01 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBD1B2RD01 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBD1B2RD01 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBD1B2RD01 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBD1B2RD01 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBD1B2RD01 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBD1B2RD01 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms