Protein–RNA interactions for Protein: A8MSY1

TMEM110-MUSTN1, TMEM110-MUSTN1 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM110-MUSTN1A8MSY1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms