Protein–RNA interactions for Protein: A6NG13

MGAT4D, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein MGAT4D, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4DA6NG13 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MGAT4DA6NG13 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MGAT4DA6NG13 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MGAT4DA6NG13 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MGAT4DA6NG13 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MGAT4DA6NG13 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MGAT4DA6NG13 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MGAT4DA6NG13 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MGAT4DA6NG13 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MGAT4DA6NG13 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MGAT4DA6NG13 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MGAT4DA6NG13 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MGAT4DA6NG13 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MGAT4DA6NG13 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MGAT4DA6NG13 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MGAT4DA6NG13 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MGAT4DA6NG13 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MGAT4DA6NG13 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MGAT4DA6NG13 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MGAT4DA6NG13 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MGAT4DA6NG13 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MGAT4DA6NG13 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MGAT4DA6NG13 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MGAT4DA6NG13 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MGAT4DA6NG13 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MGAT4DA6NG13 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MGAT4DA6NG13 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MGAT4DA6NG13 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MGAT4DA6NG13 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MGAT4DA6NG13 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MGAT4DA6NG13 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MGAT4DA6NG13 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MGAT4DA6NG13 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms