Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNDIG1LA6NDD5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1LA6NDD5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNDIG1LA6NDD5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNDIG1LA6NDD5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNDIG1LA6NDD5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNDIG1LA6NDD5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms