Protein–RNA interactions for Protein: A1A4F0

PQLC2L, Putative uncharacterized protein PQLC2L, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2LA1A4F0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PQLC2LA1A4F0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PQLC2LA1A4F0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PQLC2LA1A4F0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PQLC2LA1A4F0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PQLC2LA1A4F0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PQLC2LA1A4F0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PQLC2LA1A4F0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PQLC2LA1A4F0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC2LA1A4F0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PQLC2LA1A4F0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PQLC2LA1A4F0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PQLC2LA1A4F0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PQLC2LA1A4F0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PQLC2LA1A4F0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PQLC2LA1A4F0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PQLC2LA1A4F0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC2LA1A4F0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC2LA1A4F0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC2LA1A4F0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PQLC2LA1A4F0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PQLC2LA1A4F0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC2LA1A4F0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PQLC2LA1A4F0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PQLC2LA1A4F0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PQLC2LA1A4F0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PQLC2LA1A4F0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PQLC2LA1A4F0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PQLC2LA1A4F0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PQLC2LA1A4F0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PQLC2LA1A4F0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PQLC2LA1A4F0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PQLC2LA1A4F0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PQLC2LA1A4F0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PQLC2LA1A4F0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PQLC2LA1A4F0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms