Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E2F8A0AVK6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
E2F8A0AVK6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
E2F8A0AVK6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E2F8A0AVK6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F8A0AVK6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F8A0AVK6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E2F8A0AVK6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E2F8A0AVK6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E2F8A0AVK6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E2F8A0AVK6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
E2F8A0AVK6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E2F8A0AVK6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
E2F8A0AVK6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
E2F8A0AVK6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
E2F8A0AVK6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
E2F8A0AVK6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms