Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ72

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ72 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms