Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1X8

IGHV3-43, Immunoglobulin heavy variable 3-43, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-43A0A0B4J1X8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IGHV3-43A0A0B4J1X8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-43A0A0B4J1X8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-43A0A0B4J1X8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-43A0A0B4J1X8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-43A0A0B4J1X8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-43A0A0B4J1X8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-43A0A0B4J1X8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-43A0A0B4J1X8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-43A0A0B4J1X8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-43A0A0B4J1X8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-43A0A0B4J1X8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-43A0A0B4J1X8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-43A0A0B4J1X8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-43A0A0B4J1X8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-43A0A0B4J1X8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-43A0A0B4J1X8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-43A0A0B4J1X8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-43A0A0B4J1X8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-43A0A0B4J1X8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-43A0A0B4J1X8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-43A0A0B4J1X8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGHV3-43A0A0B4J1X8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-43A0A0B4J1X8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-43A0A0B4J1X8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-43A0A0B4J1X8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-43A0A0B4J1X8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-43A0A0B4J1X8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-43A0A0B4J1X8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-43A0A0B4J1X8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-43A0A0B4J1X8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-43A0A0B4J1X8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-43A0A0B4J1X8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms