Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIPP30301 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIPP30301 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIPP30301 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIPP30301 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIPP30301 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIPP30301 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIPP30301 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPP30301 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPP30301 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPP30301 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPP30301 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPP30301 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPP30301 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPP30301 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPP30301 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIPP30301 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIPP30301 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIPP30301 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIPP30301 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIPP30301 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIPP30301 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIPP30301 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIPP30301 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIPP30301 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIPP30301 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIPP30301 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIPP30301 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIPP30301 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MIPP30301 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MIPP30301 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MIPP30301 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MIPP30301 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MIPP30301 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MIPP30301 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MIPP30301 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MIPP30301 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MIPP30301 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MIPP30301 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MIPP30301 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MIPP30301 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MIPP30301 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MIPP30301 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MIPP30301 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MIPP30301 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MIPP30301 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MIPP30301 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms