Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.828e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 HSD17B10-204ENST00000477706 556 ntTSL 39.85□□□□□ -0.834e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GLA-201ENST00000218516 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.838e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GTF3C1-206ENST00000566779 645 ntTSL 39.74□□□□□ -0.858e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.868e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 IQGAP1-216ENST00000561132 601 ntTSL 49.59□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PYCR2-207ENST00000489681 597 ntTSL 39.55□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ST6GALNAC4-204ENST00000474282 384 ntTSL 39.52□□□□□ -0.898e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PTDSS1-205ENST00000518776 766 ntTSL 39.52□□□□□ -0.898e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-211ENST00000628474 3701 ntTSL 59.41□□□□□ -0.98e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 EXT2-208ENST00000531161 747 ntTSL 49.36□□□□□ -0.911e-10■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-207ENST00000615729 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-202ENST00000341403 1202 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.958e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-202ENST00000336643 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-206ENST00000613013 528 ntTSL 28.93□□□□□ -0.988e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-210ENST00000620706 654 ntTSL 38.93□□□□□ -0.988e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GATB-207ENST00000510720 874 ntTSL 38.75□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 EGLN3-203ENST00000487915 848 ntTSL 58.7□□□□□ -1.026e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 HLA-B-253ENST00000481849 753 nt8.57□□□□□ -1.041e-10■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-207ENST00000471765 717 ntTSL 38.22□□□□□ -1.098e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 IQGAP1-203ENST00000558491 637 ntTSL 27.72□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.188e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-206ENST00000555245 1531 ntTSL 27.6□□□□□ -1.198e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MAN2B1-215ENST00000596591 340 ntTSL 57.58□□□□□ -1.28e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GLA-205ENST00000480513 612 ntTSL 37.4□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ALG5-205ENST00000496689 756 ntTSL 57.11□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ROBO1-211ENST00000498428 3566 ntTSL 26.91□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.428e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C5-203ENST00000466280 540 ntTSL 55.97□□□□□ -1.458e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 NPC1-213ENST00000591955 561 ntTSL 45.7□□□□□ -1.51e-10■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GLA-206ENST00000486121 723 ntTSL 35.62□□□□□ -1.518e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 NUP188-203ENST00000465344 400 ntTSL 55.45□□□□□ -1.548e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 EXT2-211ENST00000534048 520 ntTSL 32.71□□□□□ -1.981e-10■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 30.1
RPS3P23396 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 30.1
RPS3P23396 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 30.1
RPS3P23396 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 30.1
RPS3P23396 PRMT5-214ENST00000553915 1931 ntTSL 215.32■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 30.1
RPS3P23396 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 30.1
RPS3P23396 LCP1-206ENST00000469227 730 ntTSL 313.69□□□□□ -0.226e-8■■■■■ 30.1
RPS3P23396 ATP6V1A-205ENST00000475322 754 ntTSL 310.95□□□□□ -0.662e-10■■■■■ 30.1
RPS3P23396 ATP6V1A-206ENST00000496747 710 ntTSL 59.5□□□□□ -0.892e-10■■■■■ 30.1
RPS3P23396 ERH-204ENST00000557697 167 ntTSL 5-1.11□□□□□ -2.596e-9■■■■■ 30.1
RPS3P23396 LGALS3BP-211ENST00000588587 1020 ntTSL 513.55□□□□□ -0.247e-32■■■■■ 30.1
RPS3P23396 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-323■■■■■ 30.1
RPS3P23396 HBA1-203ENST00000472694 674 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.321e-323■■■■■ 30.1
RPS3P23396 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 30.1
RPS3P23396 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.371e-10■■■■■ 30.1
RPS3P23396 CD59-213ENST00000533403 1847 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.871e-10■■■■■ 30.1
RPS3P23396 CD59-208ENST00000527577 686 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.891e-10■■■■■ 30.1
RPS3P23396 CD59-202ENST00000395850 1889 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.941e-10■■■■■ 30.1
RPS3P23396 HBA1-202ENST00000397797 504 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.951e-323■■■■■ 30.1
RPS3P23396 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.475e-8■■■■■ 30.1
RPS3P23396 RPL17-211ENST00000581305 593 ntTSL 59.77□□□□□ -0.855e-8■■■■■ 30.1
RPS3P23396 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 59.76□□□□□ -0.855e-8■■■■■ 30.1
RPS3P23396 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.865e-8■■■■■ 30.1
RPS3P23396 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.055e-8■■■■■ 30.1
RPS3P23396 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.225e-8■■■■■ 30.1
RPS3P23396 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 36.62□□□□□ -1.355e-8■■■■■ 30.1
RPS3P23396 RPL17-215ENST00000582782 562 ntTSL 32.74□□□□□ -1.975e-8■■■■■ 30.1
RPS3P23396 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)1.8□□□□□ -2.125e-8■■■■■ 30.1
RPS3P23396 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.522e-22■■■■■ 30.1
RPS3P23396 CTSD-204ENST00000433655 2006 ntTSL 516.79■□□□□ 0.282e-22■■■■■ 30.1
RPS3P23396 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-22■■■■■ 30.1
RPS3P23396 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.072e-22■■■■■ 30.1
RPS3P23396 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-22■■■■■ 30.1
RPS3P23396 AC068580.4-203ENST00000636397 4038 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.632e-22■■■■■ 30.1
RPS3P23396 AC002094.3-201ENST00000555059 851 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.792e-12■■■■■ 30
RPS3P23396 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.143e-8■■■■■ 30
RPS3P23396 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 30
RPS3P23396 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 30
RPS3P23396 TMBIM6-201ENST00000267115 2836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.943e-8■■■■■ 30
RPS3P23396 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 30
RPS3P23396 UBA1-208ENST00000457753 809 ntTSL 516.44■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 30
RPS3P23396 UBA1-205ENST00000427561 671 ntTSL 513.04□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 30
RPS3P23396 SERPINF1-203ENST00000570820 820 ntTSL 213.2□□□□□ -0.34e-22■■■■■ 30
RPS3P23396 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.356e-10■■■■■ 30
RPS3P23396 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 30
RPS3P23396 UROD-218ENST00000491773 676 ntTSL 213.69□□□□□ -0.226e-10■■■■■ 30
RPS3P23396 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 30
RPS3P23396 SSR2-214ENST00000526212 351 ntTSL 57.75□□□□□ -1.178e-14■■■■■ 30
RPS3P23396 LGALS3BP-206ENST00000587310 768 ntTSL 216.17■□□□□ 0.182e-25■■■■■ 30
RPS3P23396 LGALS3BP-215ENST00000589775 893 ntTSL 315.48■□□□□ 0.072e-25■■■■■ 30
RPS3P23396 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.192e-25■■■■■ 30
RPS3P23396 LGALS3BP-216ENST00000589906 540 ntTSL 312.95□□□□□ -0.342e-25■■■■■ 30
RPS3P23396 FARSA-209ENST00000592662 864 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.558e-7■■■■■ 29.9
RPS3P23396 NUP37-208ENST00000551744 762 ntTSL 511.47□□□□□ -0.579e-7■■■■■ 29.9
RPS3P23396 NUP37-207ENST00000551200 1158 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.659e-7■■■■■ 29.9
RPS3P23396 CS-209ENST00000547449 434 ntTSL 29.73□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 29.9
RPS3P23396 CS-210ENST00000547912 674 ntTSL 25.35□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 29.9
RPS3P23396 ANXA5-206ENST00000511552 1036 ntTSL 321.44■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 29.9
RPS3P23396 CTSD-205ENST00000438213 946 ntTSL 216.01■□□□□ 0.154e-23■■■■■ 29.9
RPS3P23396 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.498e-8■■■■■ 29.9
RPS3P23396 GRN-221ENST00000593167 763 ntTSL 520■□□□□ 0.794e-8■■■■■ 29.9
RPS3P23396 GRN-220ENST00000592783 541 ntTSL 415.27■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 29.9
RPS3P23396 GRN-209ENST00000587518 526 ntTSL 415.02■□□□□ -04e-8■■■■■ 29.9
RPS3P23396 GRN-218ENST00000591740 585 ntTSL 414.75□□□□□ -0.054e-8■■■■■ 29.9
RPS3P23396 GRN-211ENST00000588143 546 ntTSL 314.62□□□□□ -0.074e-8■■■■■ 29.9
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