Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 ST7-228ENST00000490039 1689 ntTSL 57.91□□□□□ -1.141e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-216ENST00000533119 742 ntTSL 57.9□□□□□ -1.141e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.191e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.21e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.241e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.311e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.341e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-211ENST00000484100 671 ntTSL 25.54□□□□□ -1.521e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.611e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 PLD3-214ENST00000492243 710 ntTSL 215.2■□□□□ 0.025e-8■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 NT5E-204ENST00000416334 689 ntTSL 35.49□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 CTSC-202ENST00000393301 598 ntTSL 212.72□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 CTSC-209ENST00000534131 583 ntTSL 212.34□□□□□ -0.431e-11■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 CTSC-206ENST00000529974 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ATP6V0B-203ENST00000468183 2432 ntTSL 1 (best)24.67■■□□□ 1.542e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ATP6V0B-208ENST00000473485 1664 ntTSL 223.54■■□□□ 1.362e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.172e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.092e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.862e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.112e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.112e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 PCDHB2-205ENST00000625033 519 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 POR-210ENST00000439297 569 ntTSL 414.47□□□□□ -0.091e-13■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.62e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TMCO1-205ENST00000476143 581 ntTSL 314.31□□□□□ -0.122e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.312e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TMCO1-202ENST00000392129 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TMCO1-201ENST00000367881 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.892e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ATP6AP1-203ENST00000429585 769 ntTSL 525.27■■□□□ 1.644e-11■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ATP6AP1-202ENST00000422890 867 ntTSL 520.34■□□□□ 0.854e-11■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ABHD2-202ENST00000562073 588 ntTSL 59.68□□□□□ -0.863e-7■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.373e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.323e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TMEM165-205ENST00000508404 1657 ntTSL 223.06■■□□□ 1.283e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TMEM165-208ENST00000511710 731 ntTSL 37.59□□□□□ -1.193e-9■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.853e-7■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 MS4A3-207ENST00000528952 923 ntTSL 26.09□□□□□ -1.433e-37■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 CTSC-207ENST00000533865 542 ntTSL 411.19□□□□□ -0.626e-7■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.414e-9■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.044e-9■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.184e-9■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-9■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 SEL1L-201ENST00000336735 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.679e-7■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.081e-16■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 NFE2L1-221ENST00000585062 556 ntTSL 416.49■□□□□ 0.231e-7■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-10■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 BST2-202ENST00000527220 335 ntTSL 29.73□□□□□ -0.853e-10■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 EMC1-210ENST00000486405 583 ntTSL 27.18□□□□□ -1.262e-7■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 MOGS-209ENST00000489655 489 ntTSL 36.78□□□□□ -1.321e-7■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 AMN-206ENST00000559525 320 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.75■□□□□ 0.914e-7■■■■□ 21.2
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SND1Q7KZF4 TMED1-205ENST00000589638 578 ntTSL 518.4■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.132e-8■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 ECM1-204ENST00000470432 3066 ntTSL 213.49□□□□□ -0.252e-8■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-8■■■■□ 21.2
SND1Q7KZF4 ECM1-201ENST00000346569 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-8■■■■□ 21.2
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SND1Q7KZF4 FGL1-205ENST00000427924 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.943e-20■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 FGL1-202ENST00000381841 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.973e-20■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 FGL1-203ENST00000398054 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.033e-20■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.093e-20■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 AIG1-204ENST00000367601 727 ntTSL 512.89□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.519e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.829e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 AIG1-206ENST00000458219 593 ntTSL 27.11□□□□□ -1.279e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.243e-13■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 520.24■□□□□ 0.833e-13■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 SPN-203ENST00000436527 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.64■□□□□ 0.573e-13■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.223e-13■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 CERS2-207ENST00000457392 545 ntTSL 322.87■■□□□ 1.254e-25■■■■□ 21.1
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SND1Q7KZF4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.343e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.123e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 ATP5J-208ENST00000486002 876 ntTSL 215.35■□□□□ 0.053e-15■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 39.3□□□□□ -0.923e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 28.71□□□□□ -1.023e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.243e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.673e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 FCGR2B-202ENST00000358671 2115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.457e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 FCGR2B-203ENST00000367961 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.627e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 FCGR2B-201ENST00000236937 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.77e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 FCGR2B-204ENST00000480308 4680 ntTSL 1 (best)10.54□□□□□ -0.727e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 B2M-210ENST00000560681 572 ntTSL 415.42■□□□□ 0.062e-16■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 B2M-207ENST00000559907 499 ntTSL 314.71□□□□□ -0.052e-16■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 B2M-205ENST00000559220 580 ntTSL 58.55□□□□□ -1.042e-16■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.661e-21■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.051e-21■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 UGGT1-202ENST00000376723 6682 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.348e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.318e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 HMGCR-207ENST00000509085 637 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.961e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 HMGCR-210ENST00000511986 487 ntTSL 58.61□□□□□ -1.031e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 ASAH1-219ENST00000636033 1940 ntTSL 522.05■■□□□ 1.121e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 ASAH1-216ENST00000635944 1960 ntTSL 519.52■□□□□ 0.711e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 ASAH1-217ENST00000635998 1845 ntTSL 518.55■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 21.1
SND1Q7KZF4 ASAH1-239ENST00000636920 1989 ntTSL 518.52■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 21.1
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