RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457392.1

CERS2-207, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CERS2, Length 545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-207ENST00000457392 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.05■■■■■ 6.56
CERS2-207ENST00000457392 ABCC9O60706 1549 aa51.18■■■■■ 5.78
CERS2-207ENST00000457392 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.47■■■■■ 5.67
CERS2-207ENST00000457392 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.57■■■■■ 5.37
CERS2-207ENST00000457392 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.37■■■■■ 5.33
CERS2-207ENST00000457392 NACADO15069 1562 aa47.89■■■■■ 5.26
CERS2-207ENST00000457392 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.71■■■■■ 5.23
CERS2-207ENST00000457392 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.61■■■■■ 5.21
CERS2-207ENST00000457392 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.3■■■■■ 5.16
CERS2-207ENST00000457392 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.01■■■■■ 5.12
CERS2-207ENST00000457392 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.99■■■■■ 5.11
CERS2-207ENST00000457392 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
CERS2-207ENST00000457392 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.2■■■■■ 4.99
CERS2-207ENST00000457392 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.19■■■■■ 4.99
CERS2-207ENST00000457392 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.16■■■■■ 4.98
CERS2-207ENST00000457392 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.13■■■■■ 4.98
CERS2-207ENST00000457392 SCRIBQ14160 1630 aa46.06■■■■■ 4.96
CERS2-207ENST00000457392 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
CERS2-207ENST00000457392 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.96■■■■■ 4.79
CERS2-207ENST00000457392 CUX2O14529 1486 aa44.26■■■■■ 4.68
CERS2-207ENST00000457392 NCAPD3P42695 1498 aa44.24■■■■■ 4.67
CERS2-207ENST00000457392 ERCC6Q03468 1493 aa44.21■■■■■ 4.67
CERS2-207ENST00000457392 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.06■■■■■ 4.64
CERS2-207ENST00000457392 SMARCA2P51531 1590 aa43.85■■■■■ 4.61
CERS2-207ENST00000457392 SMARCA4P51532 1647 aa43.84■■■■■ 4.61
CERS2-207ENST00000457392 HMGXB3Q12766 1538 aa43.83■■■■■ 4.61
CERS2-207ENST00000457392 NESP48681 1621 aa43.81■■■■■ 4.6
CERS2-207ENST00000457392 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
CERS2-207ENST00000457392 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
CERS2-207ENST00000457392 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
CERS2-207ENST00000457392 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.37■■■■■ 4.53
CERS2-207ENST00000457392 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.31■■■■■ 4.52
CERS2-207ENST00000457392 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.22■■■■■ 4.51
CERS2-207ENST00000457392 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.17■■■■■ 4.5
CERS2-207ENST00000457392 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.12■■■■■ 4.49
CERS2-207ENST00000457392 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.9■■■■■ 4.46
CERS2-207ENST00000457392 TRIM41Q8WV44 630 aa42.84■■■■■ 4.45
CERS2-207ENST00000457392 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.78■■■■■ 4.44
CERS2-207ENST00000457392 WDR62O43379 1518 aa42.68■■■■■ 4.42
CERS2-207ENST00000457392 WIZO95785 1651 aa42.67■■■■■ 4.42
CERS2-207ENST00000457392 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.49■■■■■ 4.39
CERS2-207ENST00000457392 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.42■■■■■ 4.38
CERS2-207ENST00000457392 CFTRP13569 1480 aa42.26■■■■■ 4.36
CERS2-207ENST00000457392 OSCARQ8IYS5 282 aa42.21■■■■■ 4.35
CERS2-207ENST00000457392 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
CERS2-207ENST00000457392 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
CERS2-207ENST00000457392 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
CERS2-207ENST00000457392 PRDM2Q13029 1718 aa41.75■■■■■ 4.27
CERS2-207ENST00000457392 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
CERS2-207ENST00000457392 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.7■■■■■ 4.27
CERS2-207ENST00000457392 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.7■■■■■ 4.27
CERS2-207ENST00000457392 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.7■■■■■ 4.27
CERS2-207ENST00000457392 IFT140Q96RY7 1462 aa41.66■■■■■ 4.26
CERS2-207ENST00000457392 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.63■■■■■ 4.25
CERS2-207ENST00000457392 TOPBP1Q92547 1522 aa41.55■■■■■ 4.24
CERS2-207ENST00000457392 ARHGEF11O15085 1522 aa41.51■■■■■ 4.24
CERS2-207ENST00000457392 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
CERS2-207ENST00000457392 ABCC8Q09428 1581 aa41.36■■■■■ 4.21
CERS2-207ENST00000457392 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.32■■■■■ 4.21
CERS2-207ENST00000457392 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.32■■■■■ 4.2
CERS2-207ENST00000457392 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.28■■■■■ 4.27e-9■■■■□ 20
CERS2-207ENST00000457392 CHD1O14646 1710 aa41.21■■■■■ 4.19
CERS2-207ENST00000457392 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
CERS2-207ENST00000457392 FBLN2P98095 1184 aa41.16■■■■■ 4.18
CERS2-207ENST00000457392 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
CERS2-207ENST00000457392 ARAP1Q96P48 1450 aa41.08■■■■■ 4.17
CERS2-207ENST00000457392 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
CERS2-207ENST00000457392 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41■■■■■ 4.15
CERS2-207ENST00000457392 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
CERS2-207ENST00000457392 SOGA1O94964 1423 aa40.91■■■■■ 4.14
CERS2-207ENST00000457392 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.81■■■■■ 4.12
CERS2-207ENST00000457392 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.76■■■■■ 4.12
CERS2-207ENST00000457392 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
CERS2-207ENST00000457392 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.71■■■■■ 4.11
CERS2-207ENST00000457392 WDR97A6NE52 1622 aa40.67■■■■■ 4.1
CERS2-207ENST00000457392 SYNJ1O43426 1573 aa40.63■■■■■ 4.09
CERS2-207ENST00000457392 CUX1P39880 1505 aa40.62■■■■■ 4.09
CERS2-207ENST00000457392 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
CERS2-207ENST00000457392 GRIN2BQ13224 1484 aa40.59■■■■■ 4.09
CERS2-207ENST00000457392 SYNJ2O15056 1496 aa40.51■■■■■ 4.08
CERS2-207ENST00000457392 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.39■■■■■ 4.06
CERS2-207ENST00000457392 PBRM1Q86U86 1689 aa40.38■■■■■ 4.05
CERS2-207ENST00000457392 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
CERS2-207ENST00000457392 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.23■■■■■ 4.03
CERS2-207ENST00000457392 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.22■■■■■ 4.03
CERS2-207ENST00000457392 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.1■■■■■ 4.01
CERS2-207ENST00000457392 GRIN2AQ12879 1464 aa40.07■■■■■ 4.01
CERS2-207ENST00000457392 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
CERS2-207ENST00000457392 ADAMTS12P58397 1594 aa39.97■■■■□ 3.99
CERS2-207ENST00000457392 CEP170Q5SW79 1584 aa39.97■■■■□ 3.99
CERS2-207ENST00000457392 NUP160Q12769 1436 aa39.95■■■■□ 3.99
CERS2-207ENST00000457392 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
CERS2-207ENST00000457392 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.83■■■■□ 3.97
CERS2-207ENST00000457392 SHROOM2Q13796 1616 aa39.81■■■■□ 3.96
CERS2-207ENST00000457392 TOP2BQ02880 1626 aa39.79■■■■□ 3.96
CERS2-207ENST00000457392 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.78■■■■□ 3.96
CERS2-207ENST00000457392 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.7■■■■□ 3.95
CERS2-207ENST00000457392 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
CERS2-207ENST00000457392 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.63■■■■□ 3.93
CERS2-207ENST00000457392 JPH4Q96JJ6 628 aa39.6■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.3 ms