Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.674e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RBBP4-207ENST00000460669 783 ntTSL 54.41□□□□□ -1.74e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RBBP4-212ENST00000482190 616 ntTSL 34.08□□□□□ -1.764e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.944e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.024e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SMARCAD1-202ENST00000359052 5017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best)1.9□□□□□ -2.114e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 215.51■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 30.4
AARSP49588 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.858e-7■■■■■ 30.3
AARSP49588 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.845e-7■■■■■ 30.3
AARSP49588 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.835e-7■■■■■ 30.3
AARSP49588 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 30.3
AARSP49588 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 30.3
AARSP49588 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 30.3
AARSP49588 BCOR-207ENST00000412952 288 ntTSL 514.26□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 30.3
AARSP49588 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 30
AARSP49588 SNX2-202ENST00000505854 908 ntTSL 219.83■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 30
AARSP49588 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 30
AARSP49588 SNX2-211ENST00000512394 763 ntTSL 318.46■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 30
AARSP49588 SNX2-203ENST00000505934 819 ntTSL 216.32■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 30
AARSP49588 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 30
AARSP49588 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 30
AARSP49588 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.573e-6■■■■■ 30
AARSP49588 SNX2-209ENST00000510372 1412 ntTSL 24.92□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 30
AARSP49588 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 29.8
AARSP49588 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 29.8
AARSP49588 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 29.8
AARSP49588 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 29.8
AARSP49588 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 29.7
AARSP49588 BRD9-212ENST00000495265 2843 ntTSL 220.01■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 29.7
AARSP49588 BRD9-201ENST00000466684 1417 ntTSL 217.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 29.7
AARSP49588 BRD9-208ENST00000489816 3170 ntTSL 1 (best)17.14■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 29.7
AARSP49588 BRD9-213ENST00000495794 4865 ntTSL 214.55□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 29.7
AARSP49588 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 29.7
AARSP49588 BRD9-209ENST00000490814 3477 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 29.7
AARSP49588 BRD9-211ENST00000494422 449 ntTSL 36.88□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 29.7
AARSP49588 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.342e-6■■■■■ 29.5
AARSP49588 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 222.27■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 29.5
AARSP49588 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 29.5
AARSP49588 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 29.5
AARSP49588 NECAB3-211ENST00000485399 1373 ntTSL 223.32■■□□□ 1.323e-7■■■■■ 29.5
AARSP49588 NECAB3-222ENST00000607805 969 ntTSL 522.94■■□□□ 1.263e-7■■■■■ 29.5
AARSP49588 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.063e-7■■■■■ 29.5
AARSP49588 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 221.38■■□□□ 1.013e-7■■■■■ 29.5
AARSP49588 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 521.36■■□□□ 1.013e-7■■■■■ 29.5
AARSP49588 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.943e-7■■■■■ 29.5
AARSP49588 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 220.12■□□□□ 0.813e-7■■■■■ 29.5
AARSP49588 NECAB3-214ENST00000493590 625 ntTSL 518.01■□□□□ 0.473e-7■■■■■ 29.5
AARSP49588 NECAB3-219ENST00000606690 900 ntTSL 515.59■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 29.5
AARSP49588 NECAB3-203ENST00000439478 925 ntTSL 515.59■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 29.5
AARSP49588 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 222.09■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 29.4
AARSP49588 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 29.55□□□□□ -0.889e-7■■■■■ 29.4
AARSP49588 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 415.36■□□□□ 0.053e-9■■■■■ 29.4
AARSP49588 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 215.29■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 29.4
AARSP49588 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 212.15□□□□□ -0.463e-9■■■■■ 29.4
AARSP49588 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.633e-9■■■■■ 29.4
AARSP49588 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.1□□□□□ -1.913e-9■■■■■ 29.4
AARSP49588 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.01□□□□□ -2.093e-9■■■■■ 29.4
AARSP49588 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 29.2
AARSP49588 RAB40C-211ENST00000568586 648 ntTSL 231.96■■■□□ 2.713e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.13e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.953e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.83e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.783e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 CCDC136-203ENST00000459946 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 326.11■■□□□ 1.773e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 RAB40C-209ENST00000565511 783 ntTSL 325.85■■□□□ 1.733e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 RAB40C-212ENST00000569575 692 ntTSL 225.24■■□□□ 1.633e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.63e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.563e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 HNRNPLL-211ENST00000498516 655 ntTSL 323.52■■□□□ 1.363e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.263e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.173e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.13e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 CCDC136-213ENST00000488925 552 ntAPPRIS ALT2 TSL 421.12■□□□□ 0.973e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 PTOV1-209ENST00000597793 1716 ntTSL 1 (best)20.7■□□□□ 0.93e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 RAB40C-207ENST00000563109 710 ntTSL 320.23■□□□□ 0.833e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.793e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.793e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.783e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 CCDC136-211ENST00000485998 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.01■□□□□ 0.633e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 WDR1-206ENST00000502962 1411 ntTSL 517.89■□□□□ 0.463e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 RAB40C-210ENST00000566290 753 ntTSL 317.7■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 RAB40C-202ENST00000509637 565 ntTSL 317.38■□□□□ 0.373e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.353e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 AGAP3-203ENST00000461065 1707 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.343e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 PTOV1-208ENST00000597730 327 ntTSL 216.9■□□□□ 0.33e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.33e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 WDR1-210ENST00000506246 572 ntTSL 516.79■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 WDR1-207ENST00000504739 555 ntTSL 316.79■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 PTOV1-210ENST00000598325 1438 ntTSL 516.53■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 VARS-228ENST00000495010 1007 ntTSL 515.47■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 PPIL2-211ENST00000498109 563 ntTSL 215.4■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 VARS-227ENST00000489979 658 ntTSL 315.19■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 29.1
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 74.8 ms