RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597730.1

PTOV1-208, Transcript of prostate tumor overexpressed 1, human

TSL 2

Gene PTOV1, Length 327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTOV1-208	ENST00000597730	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.73	■■■■□ 3.79
PTOV1-208	ENST00000597730	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.55	■■■■□ 3.12
PTOV1-208	ENST00000597730	ABCC9	O60706	1549 aa		34.32	■■■■□ 3.08
PTOV1-208	ENST00000597730	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PTOV1-208	ENST00000597730	NACAD	O15069	1562 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PTOV1-208	ENST00000597730	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PTOV1-208	ENST00000597730	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PTOV1-208	ENST00000597730	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
PTOV1-208	ENST00000597730	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PTOV1-208	ENST00000597730	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PTOV1-208	ENST00000597730	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.03	■■■□□ 2.72	8e-7	■■■□□ 17.5
PTOV1-208	ENST00000597730	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PTOV1-208	ENST00000597730	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PTOV1-208	ENST00000597730	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PTOV1-208	ENST00000597730	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PTOV1-208	ENST00000597730	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
PTOV1-208	ENST00000597730	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.02	■■■□□ 2.56
PTOV1-208	ENST00000597730	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.86	■■■□□ 2.53
PTOV1-208	ENST00000597730	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.14	■■■□□ 2.41
PTOV1-208	ENST00000597730	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.13	■■■□□ 2.41
PTOV1-208	ENST00000597730	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PTOV1-208	ENST00000597730	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	29.98	■■■□□ 2.39
PTOV1-208	ENST00000597730	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.94	■■■□□ 2.38
PTOV1-208	ENST00000597730	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.91	■■■□□ 2.38
PTOV1-208	ENST00000597730	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PTOV1-208	ENST00000597730	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PTOV1-208	ENST00000597730	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
PTOV1-208	ENST00000597730	NES	P48681	1621 aa		29.63	■■■□□ 2.33
PTOV1-208	ENST00000597730	WIZ	O95785	1651 aa		29.53	■■■□□ 2.32
PTOV1-208	ENST00000597730	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.5	■■■□□ 2.31
PTOV1-208	ENST00000597730	CUX2	O14529	1486 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PTOV1-208	ENST00000597730	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
PTOV1-208	ENST00000597730	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PTOV1-208	ENST00000597730	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PTOV1-208	ENST00000597730	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PTOV1-208	ENST00000597730	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PTOV1-208	ENST00000597730	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PTOV1-208	ENST00000597730	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PTOV1-208	ENST00000597730	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PTOV1-208	ENST00000597730	CFTR	P13569	1480 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTOV1-208	ENST00000597730	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTOV1-208	ENST00000597730	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTOV1-208	ENST00000597730	WDR62	O43379	1518 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTOV1-208	ENST00000597730	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTOV1-208	ENST00000597730	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTOV1-208	ENST00000597730	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PTOV1-208	ENST00000597730	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PTOV1-208	ENST00000597730	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PTOV1-208	ENST00000597730	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PTOV1-208	ENST00000597730	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PTOV1-208	ENST00000597730	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTOV1-208	ENST00000597730	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PTOV1-208	ENST00000597730	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PTOV1-208	ENST00000597730	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
PTOV1-208	ENST00000597730	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.09
PTOV1-208	ENST00000597730	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
PTOV1-208	ENST00000597730	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PTOV1-208	ENST00000597730	CUX1	P39880	1505 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTOV1-208	ENST00000597730	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.05	■■■□□ 2.08	2e-10	■■■■■ 40.1
PTOV1-208	ENST00000597730	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTOV1-208	ENST00000597730	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PTOV1-208	ENST00000597730	SOGA1	O94964	1423 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PTOV1-208	ENST00000597730	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PTOV1-208	ENST00000597730	TRIM41	Q8WV44	630 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTOV1-208	ENST00000597730	CHD1	O14646	1710 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTOV1-208	ENST00000597730	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PTOV1-208	ENST00000597730	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTOV1-208	ENST00000597730	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTOV1-208	ENST00000597730	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTOV1-208	ENST00000597730	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTOV1-208	ENST00000597730	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PTOV1-208	ENST00000597730	FBLN2	P98095	1184 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PTOV1-208	ENST00000597730	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PTOV1-208	ENST00000597730	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PTOV1-208	ENST00000597730	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PTOV1-208	ENST00000597730	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.01
PTOV1-208	ENST00000597730	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTOV1-208	ENST00000597730	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTOV1-208	ENST00000597730	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTOV1-208	ENST00000597730	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.63	■■■□□ 2.01
PTOV1-208	ENST00000597730	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTOV1-208	ENST00000597730	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTOV1-208	ENST00000597730	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.55	■■■□□ 2
PTOV1-208	ENST00000597730	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.55	■■■□□ 2
PTOV1-208	ENST00000597730	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
PTOV1-208	ENST00000597730	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTOV1-208	ENST00000597730	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PTOV1-208	ENST00000597730	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.39	■■□□□ 1.97
PTOV1-208	ENST00000597730	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PTOV1-208	ENST00000597730	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PTOV1-208	ENST00000597730	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PTOV1-208	ENST00000597730	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PTOV1-208	ENST00000597730	NUP160	Q12769	1436 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PTOV1-208	ENST00000597730	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PTOV1-208	ENST00000597730	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.12	■■□□□ 1.93
PTOV1-208	ENST00000597730	IGF1R	P08069	1367 aa		27.09	■■□□□ 1.93
PTOV1-208	ENST00000597730	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.05	■■□□□ 1.92
PTOV1-208	ENST00000597730	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27	■■□□□ 1.91
PTOV1-208	ENST00000597730	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	26.95	■■□□□ 1.9
PTOV1-208	ENST00000597730	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	26.94	■■□□□ 1.9

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