Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 PSMB4-207ENST00000495805 811 ntTSL 216.38■□□□□ 0.217e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DUS1L-210ENST00000578846 4456 ntTSL 216.16■□□□□ 0.187e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.167e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PSMB4-204ENST00000476467 2067 ntTSL 215.85■□□□□ 0.137e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DUS1L-216ENST00000584871 676 ntTSL 215.84■□□□□ 0.137e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.127e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.067e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.047e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.037e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.017e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PLD3-213ENST00000488311 750 ntTSL 215.08■□□□□ 07e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.337e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PSMB4-203ENST00000474100 755 ntTSL 58.79□□□□□ -17e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PSMB4-202ENST00000466425 665 ntTSL 27.55□□□□□ -1.27e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.267e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.277e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.753e-7■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 CDK8-205ENST00000536792 3032 ntTSL 1 (best)18.16■□□□□ 0.53e-7■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2□□□□□ -2.091e-27■■□□□ 14.5
AATFQ9NY61 FASN-213ENST00000637693 100 ntTSL 511.55□□□□□ -0.564e-8■■□□□ 14.5
AATFQ9NY61 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.11□□□□□ -1.751e-323■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-13■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.135e-13■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.065e-13■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 PPP1R8-204ENST00000431586 1029 ntTSL 315.44■□□□□ 0.065e-13■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC2.72□□□□□ -1.975e-13■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.341e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.131e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 RPSA-209ENST00000495394 2058 ntTSL 1 (best)10.22□□□□□ -0.772e-15■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.54□□□□□ -1.522e-15■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-13■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.181e-13■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.971e-13■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11e-13■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.171e-13■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.191e-13■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 SEMA4C-202ENST00000442264 817 ntTSL 324.85■■□□□ 1.572e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.822e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 ZYX-205ENST00000446634 926 ntTSL 523.21■■□□□ 1.312e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 ZYX-204ENST00000436448 632 ntTSL 422.03■■□□□ 1.122e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 ZYX-202ENST00000354434 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.2■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 14.4
AATFQ9NY61 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 327.67■■■□□ 2.025e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 517.71■□□□□ 0.435e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 ARF1-209ENST00000478424 1059 ntTSL 230.49■■■□□ 2.471e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 INSIG1-204ENST00000425172 596 ntTSL 229.17■■■□□ 2.261e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 RELT-206ENST00000545687 586 ntTSL 427.59■■■□□ 2.011e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.911e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 RELT-205ENST00000544075 744 ntTSL 326.93■■□□□ 1.91e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 ARF1-206ENST00000473949 578 ntTSL 525.43■■□□□ 1.661e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.291e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.281e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.271e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 TSC22D4-205ENST00000493217 2060 ntTSL 1 (best)21.71■■□□□ 1.071e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 SREBF2-203ENST00000435061 770 ntTSL 321.12■□□□□ 0.971e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.871e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.71e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PA2G4-207ENST00000553057 687 ntTSL 219.28■□□□□ 0.681e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 ARF1-203ENST00000470558 820 ntTSL 218.99■□□□□ 0.631e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.491e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.471e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 ARF1-204ENST00000470670 712 ntTSL 317.58■□□□□ 0.41e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.381e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 ARF1-201ENST00000272102 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 SREBF2-208ENST00000491541 4043 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.531e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.41e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PA2G4-202ENST00000550166 520 ntTSL 33.82□□□□□ -1.81e-6■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PKP4-209ENST00000479398 550 ntTSL 525.23■■□□□ 1.631e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 SKIV2L-211ENST00000485349 734 ntTSL 220.78■□□□□ 0.921e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 SKIV2L-207ENST00000471818 706 ntTSL 519.58■□□□□ 0.721e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 SKIV2L-209ENST00000483553 1307 ntTSL 519.24■□□□□ 0.671e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 SKIV2L-213ENST00000491994 866 ntTSL 218.7■□□□□ 0.581e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PKP4-204ENST00000421462 3099 ntTSL 218.65■□□□□ 0.581e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)18.25■□□□□ 0.511e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 SKIV2L-206ENST00000470453 455 ntTSL 317.85■□□□□ 0.451e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 SKIV2L-204ENST00000465703 4507 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.251e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 SLC25A39-213ENST00000591006 2217 ntTSL 215.46■□□□□ 0.071e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.111e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 SKIV2L-208ENST00000474839 3378 ntTSL 213.57□□□□□ -0.241e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.421e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PKP4-203ENST00000411900 552 ntTSL 412.32□□□□□ -0.441e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.531e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 310.79□□□□□ -0.681e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.861e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.881e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -11e-7■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 DYRK1A-207ENST00000462274 1189 ntTSL 1 (best)31.21■■■□□ 2.591e-8■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.421e-12■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 CKAP5-212ENST00000533413 3084 ntTSL 1 (best)5.88□□□□□ -1.471e-12■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.481e-12■■□□□ 14.3
AATFQ9NY61 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.711e-12■■□□□ 14.3
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