Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00299Q6ZSB3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms