RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312579.3

CCDC85B-201, Transcript of coiled-coil domain containing 85B, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CCDC85B, Length 1,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85B-201ENST00000312579 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.88■■■■■ 6.06
CCDC85B-201ENST00000312579 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.53■■■■■ 5.04
CCDC85B-201ENST00000312579 ABCC9O60706 1549 aa44.97■■■■■ 4.79
CCDC85B-201ENST00000312579 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
CCDC85B-201ENST00000312579 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.05■■■■■ 4.64
CCDC85B-201ENST00000312579 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.67■■■■■ 4.58
CCDC85B-201ENST00000312579 NACADO15069 1562 aa43.58■■■■■ 4.57
CCDC85B-201ENST00000312579 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.51■■■■■ 4.56
CCDC85B-201ENST00000312579 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.45■■■■■ 4.55
CCDC85B-201ENST00000312579 SCRIBQ14160 1630 aa42.72■■■■■ 4.43
CCDC85B-201ENST00000312579 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.57■■■■■ 4.4
CCDC85B-201ENST00000312579 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.52■■■■■ 4.4
CCDC85B-201ENST00000312579 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.25■■■■■ 4.35
CCDC85B-201ENST00000312579 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.21■■■■■ 4.35
CCDC85B-201ENST00000312579 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.22■■■■■ 4.19
CCDC85B-201ENST00000312579 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
CCDC85B-201ENST00000312579 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
CCDC85B-201ENST00000312579 SMARCA4P51532 1647 aa40.86■■■■■ 4.13
CCDC85B-201ENST00000312579 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.85■■■■■ 4.13
CCDC85B-201ENST00000312579 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
CCDC85B-201ENST00000312579 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.65■■■■■ 4.1
CCDC85B-201ENST00000312579 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.62■■■■■ 4.09
CCDC85B-201ENST00000312579 WIZO95785 1651 aa40.46■■■■■ 4.07
CCDC85B-201ENST00000312579 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.44■■■■■ 4.06
CCDC85B-201ENST00000312579 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
CCDC85B-201ENST00000312579 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.37■■■■■ 4.05
CCDC85B-201ENST00000312579 SMARCA2P51531 1590 aa40.36■■■■■ 4.05
CCDC85B-201ENST00000312579 NCAPD3P42695 1498 aa40.24■■■■■ 4.03
CCDC85B-201ENST00000312579 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
CCDC85B-201ENST00000312579 HMGXB3Q12766 1538 aa40.08■■■■■ 4.01
CCDC85B-201ENST00000312579 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
CCDC85B-201ENST00000312579 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.58■■■■□ 3.93
CCDC85B-201ENST00000312579 NESP48681 1621 aa39.19■■■■□ 3.86
CCDC85B-201ENST00000312579 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.16■■■■□ 3.86
CCDC85B-201ENST00000312579 CFTRP13569 1480 aa39.08■■■■□ 3.85
CCDC85B-201ENST00000312579 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.02■■■■□ 3.84
CCDC85B-201ENST00000312579 PRDM2Q13029 1718 aa38.78■■■■□ 3.8
CCDC85B-201ENST00000312579 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.76■■■■□ 3.79
CCDC85B-201ENST00000312579 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.73■■■■□ 3.79
CCDC85B-201ENST00000312579 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.67■■■■□ 3.78
CCDC85B-201ENST00000312579 ERCC6Q03468 1493 aa38.64■■■■□ 3.78
CCDC85B-201ENST00000312579 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.57■■■■□ 3.77
CCDC85B-201ENST00000312579 ABCC8Q09428 1581 aa38.45■■■■□ 3.75
CCDC85B-201ENST00000312579 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.34■■■■□ 3.73
CCDC85B-201ENST00000312579 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
CCDC85B-201ENST00000312579 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
CCDC85B-201ENST00000312579 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.29■■■■□ 3.72
CCDC85B-201ENST00000312579 CUX1P39880 1505 aa38.26■■■■□ 3.71
CCDC85B-201ENST00000312579 TOPBP1Q92547 1522 aa38.2■■■■□ 3.71
CCDC85B-201ENST00000312579 SYNJ1O43426 1573 aa38.19■■■■□ 3.7
CCDC85B-201ENST00000312579 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.19■■■■□ 3.7
CCDC85B-201ENST00000312579 WDR62O43379 1518 aa38.17■■■■□ 3.7
CCDC85B-201ENST00000312579 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.12■■■■□ 3.69
CCDC85B-201ENST00000312579 TOP2BQ02880 1626 aa38.07■■■■□ 3.69
CCDC85B-201ENST00000312579 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.05■■■■□ 3.68
CCDC85B-201ENST00000312579 TRIM41Q8WV44 630 aa38.01■■■■□ 3.67
CCDC85B-201ENST00000312579 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.99■■■■□ 3.67
CCDC85B-201ENST00000312579 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
CCDC85B-201ENST00000312579 CUX2O14529 1486 aa37.87■■■■□ 3.65
CCDC85B-201ENST00000312579 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.85■■■■□ 3.65
CCDC85B-201ENST00000312579 SOGA1O94964 1423 aa37.81■■■■□ 3.64
CCDC85B-201ENST00000312579 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
CCDC85B-201ENST00000312579 IFT140Q96RY7 1462 aa37.7■■■■□ 3.63
CCDC85B-201ENST00000312579 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.59■■■■□ 3.61
CCDC85B-201ENST00000312579 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
CCDC85B-201ENST00000312579 WDR97A6NE52 1622 aa37.58■■■■□ 3.61
CCDC85B-201ENST00000312579 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
CCDC85B-201ENST00000312579 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.49■■■■□ 3.59
CCDC85B-201ENST00000312579 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.47■■■■□ 3.59
CCDC85B-201ENST00000312579 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
CCDC85B-201ENST00000312579 KIF27Q86VH2 1401 aa37.39■■■■□ 3.58
CCDC85B-201ENST00000312579 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.38■■■■□ 3.57
CCDC85B-201ENST00000312579 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.37■■■■□ 3.57
CCDC85B-201ENST00000312579 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
CCDC85B-201ENST00000312579 GRIN2BQ13224 1484 aa37.22■■■■□ 3.55
CCDC85B-201ENST00000312579 PBRM1Q86U86 1689 aa37.22■■■■□ 3.55
CCDC85B-201ENST00000312579 IGF1RP08069 1367 aa37.19■■■■□ 3.54
CCDC85B-201ENST00000312579 EEA1Q15075 1411 aa37.14■■■■□ 3.54
CCDC85B-201ENST00000312579 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.12■■■■□ 3.53
CCDC85B-201ENST00000312579 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.12■■■■□ 3.53
CCDC85B-201ENST00000312579 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.11■■■■□ 3.53
CCDC85B-201ENST00000312579 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
CCDC85B-201ENST00000312579 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.98■■■■□ 3.51
CCDC85B-201ENST00000312579 ADAMTS12P58397 1594 aa36.97■■■■□ 3.51
CCDC85B-201ENST00000312579 CUL7Q14999 1698 aa36.94■■■■□ 3.5
CCDC85B-201ENST00000312579 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.93■■■■□ 3.5
CCDC85B-201ENST00000312579 FBLN2P98095 1184 aa36.91■■■■□ 3.5
CCDC85B-201ENST00000312579 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.9■■■■□ 3.5
CCDC85B-201ENST00000312579 PRXQ9BXM0 1461 aa36.89■■■■□ 3.5
CCDC85B-201ENST00000312579 SYNJ2O15056 1496 aa36.87■■■■□ 3.49
CCDC85B-201ENST00000312579 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
CCDC85B-201ENST00000312579 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.81■■■■□ 3.48
CCDC85B-201ENST00000312579 CHD1O14646 1710 aa36.79■■■■□ 3.48
CCDC85B-201ENST00000312579 GRIN2AQ12879 1464 aa36.76■■■■□ 3.48
CCDC85B-201ENST00000312579 KIF21BO75037 1637 aa36.75■■■■□ 3.47
CCDC85B-201ENST00000312579 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.67■■■■□ 3.46
CCDC85B-201ENST00000312579 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.64■■■■□ 3.46
CCDC85B-201ENST00000312579 GOLGA3Q08378 1498 aa36.63■■■■□ 3.45
CCDC85B-201ENST00000312579 CEP170Q5SW79 1584 aa36.58■■■■□ 3.45
CCDC85B-201ENST00000312579 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms