Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 FLYWCH1-204ENST00000570425 721 ntTSL 328.72■■■□□ 2.192e-7■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 FLYWCH1-207ENST00000571140 359 ntTSL 521.56■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 FLYWCH1-210ENST00000573525 643 ntTSL 320.2■□□□□ 0.822e-7■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 KCMF1-204ENST00000456682 661 ntTSL 327.2■■□□□ 1.945e-9■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.285e-9■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 PPP1R8-204ENST00000431586 1029 ntTSL 312.07□□□□□ -0.486e-22■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 SLC25A39-216ENST00000592857 837 ntTSL 321.43■■□□□ 1.028e-32■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-215ENST00000589536 546 ntTSL 324.72■■□□□ 1.556e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-221ENST00000593167 763 ntTSL 521.07■□□□□ 0.966e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.286e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.256e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-219ENST00000592323 550 ntTSL 416.42■□□□□ 0.226e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-207ENST00000587109 535 ntTSL 216.36■□□□□ 0.216e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-220ENST00000592783 541 ntTSL 416.31■□□□□ 0.26e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-203ENST00000585512 562 ntTSL 416.31■□□□□ 0.26e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-209ENST00000587518 526 ntTSL 416.15■□□□□ 0.186e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-218ENST00000591740 585 ntTSL 415.73■□□□□ 0.116e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-212ENST00000588170 588 ntTSL 215.73■□□□□ 0.116e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-211ENST00000588143 546 ntTSL 315.51■□□□□ 0.076e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-210ENST00000587958 560 ntTSL 215.42■□□□□ 0.066e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-208ENST00000587387 614 ntTSL 415.42■□□□□ 0.066e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-206ENST00000586782 843 ntTSL 513.99□□□□□ -0.176e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 GRN-213ENST00000588237 558 ntTSL 513.52□□□□□ -0.256e-15■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-16■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.077e-8■■■■■ 40.2
DDX3XO00571 DUS4L-202ENST00000422290 1610 ntTSL 219.54■□□□□ 0.727e-8■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 DUS4L-205ENST00000443233 1676 ntTSL 217.52■□□□□ 0.47e-8■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.247e-8■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 DUS4L-207ENST00000467916 744 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.17e-8■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 DUS4L-204ENST00000436411 2280 ntTSL 215.55■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 DUS4L-211ENST00000498786 491 ntTSL 313.8□□□□□ -0.27e-8■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 DUS4L-203ENST00000431839 1375 ntTSL 313.22□□□□□ -0.297e-8■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 DUS4L-206ENST00000458611 857 ntTSL 312.9□□□□□ -0.347e-8■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.192e-31■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 VMA21-203ENST00000477649 485 ntTSL 38.55□□□□□ -1.042e-31■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-31■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 PPID-201ENST00000307720 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.666e-18■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 MICALL1-204ENST00000445494 808 ntTSL 218.46■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 40.1
DDX3XO00571 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 40
DDX3XO00571 OCLN-201ENST00000355237 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 40
DDX3XO00571 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.418e-9■■■■■ 40
DDX3XO00571 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.698e-8■■■■■ 40
DDX3XO00571 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.648e-8■■■■■ 40
DDX3XO00571 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.868e-8■■■■■ 40
DDX3XO00571 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.448e-8■■■■■ 40
DDX3XO00571 PAM-214ENST00000506127 510 ntTSL 39.15□□□□□ -0.949e-11■■■■■ 40
DDX3XO00571 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.183e-26■■■■■ 40
DDX3XO00571 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)14.73□□□□□ -0.053e-26■■■■■ 40
DDX3XO00571 DGAT2-206ENST00000604733 885 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.287e-9■■■■■ 40
DDX3XO00571 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.692e-24■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.332e-24■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 EPCAM-204ENST00000456133 1501 ntTSL 513.03□□□□□ -0.322e-24■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.565e-80■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 RPL15-209ENST00000436146 1990 ntTSL 57.26□□□□□ -1.255e-80■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.371e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GLT8D1-210ENST00000484163 1889 ntTSL 528.63■■■□□ 2.171e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.061e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.031e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GLT8D1-212ENST00000487642 770 ntTSL 221.16■□□□□ 0.981e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GLT8D1-214ENST00000497436 577 ntTSL 418.49■□□□□ 0.551e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GLT8D1-205ENST00000464705 622 ntTSL 316.66■□□□□ 0.261e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 FBXO6-203ENST00000474239 803 ntTSL 327.73■■■□□ 2.038e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.863e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-214ENST00000639665 2090 ntTSL 526.49■■□□□ 1.836e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-211ENST00000639398 2127 ntTSL 526.15■■□□□ 1.786e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.586e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 224.78■■□□□ 1.569e-12■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.516e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.458e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TKFC-217ENST00000533393 597 ntTSL 523.93■■□□□ 1.422e-11■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.296e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.296e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-209ENST00000639115 2524 ntTSL 522.91■■□□□ 1.266e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TKFC-211ENST00000529620 433 ntTSL 322.87■■□□□ 1.252e-11■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-217ENST00000640530 2426 ntTSL 522.58■■□□□ 1.216e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TKFC-212ENST00000530057 639 ntTSL 322.29■■□□□ 1.162e-11■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.166e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.136e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.096e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TKFC-214ENST00000530456 589 ntTSL 221.63■■□□□ 1.052e-11■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.012e-15■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TKFC-209ENST00000529121 1510 ntTSL 521.22■□□□□ 0.992e-11■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 NFKBIA-202ENST00000553342 212 ntTSL 521.21■□□□□ 0.993e-18■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 HGSNAT-202ENST00000517319 491 ntTSL 420.75■□□□□ 0.915e-14■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.874e-10■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 HGSNAT-206ENST00000520704 1451 ntTSL 1 (best)20.06■□□□□ 0.85e-14■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-219ENST00000640967 2569 ntTSL 519.65■□□□□ 0.746e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-11■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 SERHL2-206ENST00000447870 563 ntTSL 419.37■□□□□ 0.696e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 LRRC20-202ENST00000357631 2906 ntTSL 219.26■□□□□ 0.674e-10■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.674e-10■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.662e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TKFC-215ENST00000531820 480 ntTSL 418.99■□□□□ 0.636e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 NFKBIA-205ENST00000555629 599 ntTSL 218.83■□□□□ 0.63e-18■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.596e-9■■■■■ 39.9
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