RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639398.1

ME2-211, Transcript of malic enzyme 2, humanhuman

TSL 5

Gene ME2, Length 2,127 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2-211ENST00000639398 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.6■■■■■ 6.01
ME2-211ENST00000639398 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.33■■■■■ 4.85
ME2-211ENST00000639398 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.69
ME2-211ENST00000639398 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.64■■■■■ 4.58
ME2-211ENST00000639398 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.4■■■■■ 4.54
ME2-211ENST00000639398 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.4■■■■■ 4.54
ME2-211ENST00000639398 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.57■■■■■ 4.41
ME2-211ENST00000639398 ABCC9O60706 1549 aa42.4■■■■■ 4.38
ME2-211ENST00000639398 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
ME2-211ENST00000639398 NACADO15069 1562 aa42.11■■■■■ 4.33
ME2-211ENST00000639398 SCRIBQ14160 1630 aa41.96■■■■■ 4.31
ME2-211ENST00000639398 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.56■■■■■ 4.24
ME2-211ENST00000639398 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
ME2-211ENST00000639398 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.97■■■■■ 4.15
ME2-211ENST00000639398 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.91■■■■■ 4.14
ME2-211ENST00000639398 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.77■■■■■ 4.12
ME2-211ENST00000639398 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.72■■■■■ 4.11
ME2-211ENST00000639398 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
ME2-211ENST00000639398 WIZO95785 1651 aa40.41■■■■■ 4.06
ME2-211ENST00000639398 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.38■■■■■ 4.06
ME2-211ENST00000639398 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.04
ME2-211ENST00000639398 SMARCA4P51532 1647 aa40.23■■■■■ 4.03
ME2-211ENST00000639398 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
ME2-211ENST00000639398 TRIM41Q8WV44 630 aa39.74■■■■□ 3.95
ME2-211ENST00000639398 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.68■■■■□ 3.94
ME2-211ENST00000639398 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.65■■■■□ 3.94
ME2-211ENST00000639398 SMARCA2P51531 1590 aa39.62■■■■□ 3.93
ME2-211ENST00000639398 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
ME2-211ENST00000639398 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.52■■■■□ 3.92
ME2-211ENST00000639398 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.44■■■■□ 3.9
ME2-211ENST00000639398 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
ME2-211ENST00000639398 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
ME2-211ENST00000639398 ABCC8Q09428 1581 aa39.08■■■■□ 3.85
ME2-211ENST00000639398 NCAPD3P42695 1498 aa38.95■■■■□ 3.82
ME2-211ENST00000639398 HMGXB3Q12766 1538 aa38.87■■■■□ 3.81
ME2-211ENST00000639398 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.7■■■■□ 3.79
ME2-211ENST00000639398 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.6■■■■□ 3.77
ME2-211ENST00000639398 SOGA1O94964 1423 aa38.56■■■■□ 3.76
ME2-211ENST00000639398 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.51■■■■□ 3.76
ME2-211ENST00000639398 SYNJ1O43426 1573 aa38.5■■■■□ 3.75
ME2-211ENST00000639398 EEA1Q15075 1411 aa38.49■■■■□ 3.75
ME2-211ENST00000639398 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.38■■■■□ 3.73
ME2-211ENST00000639398 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.34■■■■□ 3.73
ME2-211ENST00000639398 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.32■■■■□ 3.72
ME2-211ENST00000639398 CFTRP13569 1480 aa38.31■■■■□ 3.72
ME2-211ENST00000639398 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.23■■■■□ 3.71
ME2-211ENST00000639398 TOP2BQ02880 1626 aa38.23■■■■□ 3.71
ME2-211ENST00000639398 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.14■■■■□ 3.7
ME2-211ENST00000639398 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.11■■■■□ 3.69
ME2-211ENST00000639398 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.04■■■■□ 3.68
ME2-211ENST00000639398 GOLGA3Q08378 1498 aa38.03■■■■□ 3.68
ME2-211ENST00000639398 CUX1P39880 1505 aa38■■■■□ 3.67
ME2-211ENST00000639398 HRCP23327 699 aa37.99■■■■□ 3.67
ME2-211ENST00000639398 CEP162Q5TB80 1403 aa37.98■■■■□ 3.67
ME2-211ENST00000639398 PRDM2Q13029 1718 aa37.97■■■■□ 3.67
ME2-211ENST00000639398 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.95■■■■□ 3.67
ME2-211ENST00000639398 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
ME2-211ENST00000639398 KIF21BO75037 1637 aa37.93■■■■□ 3.66
ME2-211ENST00000639398 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.7■■■■□ 3.63
ME2-211ENST00000639398 KIF27Q86VH2 1401 aa37.64■■■■□ 3.62
ME2-211ENST00000639398 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
ME2-211ENST00000639398 PRXQ9BXM0 1461 aa37.6■■■■□ 3.61
ME2-211ENST00000639398 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.6■■■■□ 3.61
ME2-211ENST00000639398 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.54■■■■□ 3.6
ME2-211ENST00000639398 NESP48681 1621 aa37.5■■■■□ 3.59
ME2-211ENST00000639398 CLIP1P30622 1438 aa37.5■■■■□ 3.59
ME2-211ENST00000639398 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.46■■■■□ 3.59
ME2-211ENST00000639398 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.41■■■■□ 3.58
ME2-211ENST00000639398 CUX2O14529 1486 aa37.38■■■■□ 3.58
ME2-211ENST00000639398 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.36■■■■□ 3.57
ME2-211ENST00000639398 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.34■■■■□ 3.57
ME2-211ENST00000639398 IGF1RP08069 1367 aa37.3■■■■□ 3.56
ME2-211ENST00000639398 TOPBP1Q92547 1522 aa37.27■■■■□ 3.56
ME2-211ENST00000639398 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.27■■■■□ 3.56
ME2-211ENST00000639398 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
ME2-211ENST00000639398 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
ME2-211ENST00000639398 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.17■■■■□ 3.54
ME2-211ENST00000639398 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
ME2-211ENST00000639398 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.12■■■■□ 3.53
ME2-211ENST00000639398 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.11■■■■□ 3.53
ME2-211ENST00000639398 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
ME2-211ENST00000639398 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.1■■■■□ 3.53
ME2-211ENST00000639398 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
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ME2-211ENST00000639398 APLP2Q06481 763 aa36.94■■■■□ 3.5
ME2-211ENST00000639398 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.93■■■■□ 3.5
ME2-211ENST00000639398 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.89■■■■□ 3.5
ME2-211ENST00000639398 WDR97A6NE52 1622 aa36.84■■■■□ 3.49
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ME2-211ENST00000639398 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
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ME2-211ENST00000639398 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
ME2-211ENST00000639398 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.66■■■■□ 3.46
ME2-211ENST00000639398 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.63■■■■□ 3.45
ME2-211ENST00000639398 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
ME2-211ENST00000639398 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
ME2-211ENST00000639398 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
ME2-211ENST00000639398 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.45■■■■□ 3.43
ME2-211ENST00000639398 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
ME2-211ENST00000639398 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.42■■■■□ 3.42
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